结论：公务员名下有公司但已注销，是否会被开除需视具体情况而定，主要取决于公务员的行为是否违反了相关法律法规及单位规定。
分析角度一：法律法规层面
公务员法规定：
- 根据《中华人民共和国公务员法》第五十九条的规定，公务员不得违反有关规定从事或者参与营利性活动，在企业或者其他营利性组织中兼任职务。这是公务员行为的基本准则，旨在确保公务员的公正性和廉洁性。
违规后果：
- 如果公务员在任职期间名下有公司，即使该公司后来注销，这一行为本身已经违反了公务员法的规定。根据公务员法的相关规定，对于违反规定的公务员，根据情节轻重，会给予相应的处分，包括警告、记过、记大过、降级、撤职、开除等。
分析角度二：单位规定与实际情况
单位规定：
- 除了国家法律法规外，各单位还可能根据自身情况制定更为具体的规定。这些规定可能涉及公务员的兼职、经商等行为，以及相应的处罚措施。
实际情况考量：
- 在处理此类案件时，除了考虑法律法规外，还会综合考虑公务员的具体行为、情节轻重、是否造成不良影响等因素。例如，如果公务员名下的公司并未实际运营，或者注销行为是在发现违规后及时采取的补救措施，且未造成不良影响，那么可能不会受到开除的严厉处罚。
分析角度三：注销行为的影响
注销的及时性：
- 如果公务员在发现自己的行为违反规定后，及时注销了名下的公司，并主动向单位报告，这可能被视为一种积极改正的态度，有助于减轻处罚。
注销后的影响：
- 然而，即使公司已经注销，公务员的违规行为仍然存在，且可能已经对单位的声誉和公务员的形象造成了损害。因此，注销行为本身并不能完全消除违规的后果。
建议：
- 主动报告与改正：如果公务员发现自己名下有公司，应立即向单位报告，并尽快采取注销等补救措施。同时，应积极配合单位的调查和处理工作，表现出诚恳的态度。
- 了解并遵守规定：公务员应深入了解并严格遵守国家法律法规和单位规定，避免从事任何违规行为。
- 寻求法律帮助：如果公务员对相关规定或处理结果有疑问或不满，可以寻求专业的法律帮助，以维护自己的合法权益。
总结：公务员名下有公司但已注销，是否会被开除需根据具体情况判断。关键在于公务员的行为是否违反了相关法律法规及单位规定，以及违规行为的情节轻重和是否造成不良影响。因此，公务员应严格遵守规定，避免从事任何违规行为。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。