有权赦免的国家机关在我国是国家主席。以下是对此问题的详细分析：

1. 赦免权的法律基础：

   • 根据我国《宪法》的相关规定，国家主席根据全国人民代表大会和全国人民代表大会常务委员会的决定，行使公布法律、任免国务院组成人员等职权，其中就包括发布特赦令的权力。特赦是赦免的一种形式，它是对特定罪犯的赦免，通常由国家主席根据全国人大常委会的决定来发布特赦令。

2. 赦免权的行使程序：

   • 赦免权的行使并非国家主席单方面决定，而是需要经过全国人民代表大会或其常务委员会的审议和决定。国家主席根据这些机构的决定来发布特赦令，体现了我国政治体制中的民主集中制原则。

3. 赦免与司法独立的关系：

   • 赦免并不干涉司法独立。司法独立是指司法机关在审判案件时，不受其他行政机关、社会团体和个人的干涉。而赦免是在司法审判之后，对特定罪犯的刑罚执行进行减免或免除，它是对司法结果的一种特殊处理方式，并不影响司法机关在审判过程中的独立性和公正性。

4. 赦免的实践意义：

   • 赦免制度在我国历史上有着悠久的传统，它体现了国家对罪犯的宽容和人文关怀。在现代社会，赦免制度仍然具有重要的实践意义，它可以用于庆祝重大节日、纪念日或国家重要事件，也可以用于对特定罪犯的特殊处理，如因政治原因或历史原因而受冤的罪犯。

总结与建议：

• 有权赦免的国家机关在我国是国家主席，但赦免权的行使需要经过全国人民代表大会或其常务委员会的审议和决定。
• 赦免制度体现了国家的宽容和人文关怀，但在实践中需要谨慎行使，确保赦免的公正性和合理性。
• 如有关于赦免制度或相关法律问题的进一步疑问，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见。