只有购房合同没有房产证，法院在特定情况下是有可能会查封房屋的。以下从不同角度为你详细分析：
法律背景与依据
根据相关法律规定，法院查封房产通常基于房产的权属状况以及案件的具体情况。虽然房产证是证明房屋所有权的重要法律文件，但并非唯一依据。在司法实践中，如果购房合同真实有效，且购房者已经实际占有、使用房屋，并支付了相应房款，即使尚未取得房产证，法院在认定房屋权属时，也会综合考虑这些因素。
可能查封的情况
购房合同合法有效且购房者已实际占有房屋：
- 如果购房合同是双方真实意思表示，且内容合法，没有违反法律、行政法规的强制性规定，那么该合同是有效的。
- 如果购房者已经实际占有、使用房屋，并支付了相应房款，这表明购房者对房屋享有实际的权益。
- 在这种情况下，如果房屋涉及诉讼，且法院认为有必要查封以保障诉讼的顺利进行或执行判决，那么即使没有房产证，法院也有可能查封房屋。
房屋存在权属争议或涉及其他法律纠纷：
- 如果房屋存在权属争议，比如卖方一房多卖，或者房屋涉及其他法律纠纷，如继承、赠与等，那么法院在审理相关案件时，可能会根据案件需要查封房屋。
- 在这种情况下，购房合同虽然存在，但房屋的权属并不明确，法院为了保障各方当事人的合法权益，可能会采取查封措施。
购房者如何应对
保留好购房合同及相关证据：
- 购房者应妥善保管购房合同、付款凭证、房屋交接单等相关证据，以证明自己对房屋享有合法权益。
及时办理房产证：
- 购房者应尽快与卖方协商办理房产证过户手续，以取得房屋的合法所有权。
- 如果卖方不配合或存在其他障碍，购房者可以向法院提起诉讼，要求卖方履行合同义务或赔偿损失。
在诉讼中积极主张权利：
- 如果房屋被查封，购房者应及时向法院提出异议，主张自己对房屋享有合法权益，并要求解除查封。
- 购房者可以提供购房合同、付款凭证、房屋交接单等证据来支持自己的主张。
风险提示
- 购房合同可能存在无效或可撤销的情形：如果购房合同存在无效或可撤销的情形，如卖方无权处分房屋、合同内容违反法律强制性规定等，那么购房者的权益可能无法得到保障。
- 房屋可能被其他债权人查封：如果卖方存在其他债务纠纷，且房屋被其他债权人申请查封，那么购房者可能面临房屋被拍卖、变卖的风险。
建议：在购买房屋时，务必确保购房合同的合法性和有效性，并尽快办理房产证过户手续。如果遇到房屋被查封等法律问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。