付款时间限制在合同中是可以约定为90天的，但具体是否可行及合法，需结合合同类型、交易习惯及双方协商情况综合判断。以下从不同角度为你详细分析：

一、合同自由原则下的约定

1. 合同自由原则：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同双方当事人在不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗的前提下，有权自由约定合同的内容，包括付款时间。因此，从原则上讲，双方可以在合同中约定付款时间为90天。

2. 约定需明确：在约定付款时间时，应确保条款表述清晰、明确，避免产生歧义。例如，可以明确约定“买方应在收到货物后90天内支付全部货款”或“双方同意，付款期限为合同签订之日起90天”。

二、不同合同类型下的考虑

1. 买卖合同：在买卖合同中，付款时间的约定通常与交货时间、验收时间等紧密相关。如果双方协商一致，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么约定90天的付款时间是可行的。

2. 服务合同：在服务合同中，付款时间可能与服务完成的时间、验收合格的时间等挂钩。同样地，只要双方协商一致，且符合法律法规的规定，90天的付款期限也是可以被接受的。

3. 其他合同类型：对于其他类型的合同，如租赁合同、承揽合同等，付款时间的约定也应根据合同的具体性质和交易习惯来确定。只要双方达成一致，且不违反法律法规的强制性规定，90天的付款期限同样具有法律效力。

三、交易习惯与行业惯例

1. 交易习惯：在某些行业或地区，可能存在特定的交易习惯或行业惯例。如果双方约定的付款时间符合当地的交易习惯或行业惯例，那么该约定通常会被认为是合理的。

2. 考虑对方利益：在约定付款时间时，也应考虑对方的利益。如果约定的付款时间过长，可能会给对方带来资金压力或风险。因此，在协商付款时间时，应尽量寻求双方利益的平衡。

四、法律后果与风险提示

1. 违约责任：如果一方未按照约定的付款时间支付款项，可能构成违约行为。根据合同法的规定，违约方应承担违约责任，包括支付违约金、赔偿损失等。

2. 诉讼时效：在约定付款时间时，也应注意诉讼时效的问题。如果付款时间过长，可能会增加对方在诉讼时效期间内不主张权利的风险。因此，在约定付款时间时，应合理考虑诉讼时效的因素。

建议：在约定付款时间时，双方应充分协商、明确条款，并考虑交易习惯、行业惯例以及对方的利益。如果可能的话，可以咨询专业律师的意见，以确保约定的合法性和有效性。如果你在合同签订或履行过程中遇到任何法律问题，都可以直接向我咨询。