协议书存在重大误解时，当事人有权请求人民法院或仲裁机构予以撤销该协议书，并可根据实际情况采取协商解决、行使撤销权或要求赔偿损失等措施来维护自身权益。以下是对此问题的详细分析：
一、明确重大误解的构成要件
在采取任何行动之前，首先需要确认协议书中的误解是否构成重大误解。根据《中华人民共和国民法典》第一百四十七条及相关司法解释，重大误解通常包括以下要件：
- 误解的内容：行为人因对行为的性质、对方当事人、标的物的品种、质量、规格和数量等的错误认识，使行为的后果与自己的意思相悖。例如，在签订买卖合同时，误将低质量商品当作高质量商品购买。
- 误解的程度：必须是重大的误解，即该误解足以影响当事人的决策，导致合同目的无法实现或严重偏离预期。如上述例子中，如果低质量商品与高质量商品价格相差悬殊，且购买者是基于高质量商品的预期进行购买，则构成重大误解。
- 因果关系：误解与订立协议书之间存在直接的因果关系，即如果没有误解，当事人就不会订立该协议书。
- 表意人不知情且非故意：误解是由表意人自己的过失造成的，而非受欺诈、胁迫等外部因素所致，且表意人在订立协议书时对此不知情。
二、及时采取措施
一旦确认构成重大误解，当事人应及时采取措施，以避免损失扩大并维护自身权益。具体措施包括：
协商解决：
- 尝试与对方进行友好协商，寻求双方都能接受的解决方案。
- 如果能够达成一致意见，可以签订补充协议或修改原协议书条款，以纠正误解并继续履行协议书。
行使撤销权：
- 如果协商无果，当事人可以向人民法院或仲裁机构申请撤销协议书。
- 根据法律规定，撤销权的行使有一定的期限限制，通常为自知道或应当知道撤销事由之日起九十日内。因此，当事人应在发现误解后尽快行使撤销权，以免错过时效。
- 在行使撤销权时，需要提交相关证据材料，如协议书文本、沟通记录、误解的证明等，以支持其主张。
赔偿损失：
- 如果因重大误解导致协议书被撤销，给对方造成损失的，行为人可能需要承担一定的赔偿责任。
- 赔偿的范围通常限于对方因此遭受的实际损失，如为准备履行协议书而支出的费用等。但需要注意的是，如果行为人能够证明自己无过错或对方也存在过错，则可能减轻或免除赔偿责任。
三、注意事项
在处理协议书重大误解问题时，还需要注意以下几点：
- 保留证据：在整个过程中，应妥善保留所有与协议书相关的证据材料，以便在需要时提供证明。这些证据材料可能包括协议书文本、沟通记录、交易凭证等。
- 了解法律程序：熟悉相关法律法规和诉讼程序，以便在必要时能够迅速采取行动。例如，了解撤销权的行使期限、申请撤销协议书的流程等。
- 及时咨询：如果情况复杂或涉及较大金额，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见和帮助，以确保你的权益得到充分保障。
示例说明：假设甲与乙签订了一份买卖合同，约定甲向乙购买一批高质量钢材。然而，在签订合同时，甲误将低质量钢材当作高质量钢材进行购买，并支付了相应的价款。后来，甲发现钢材质量不符合约定，且价格远高于市场价。此时，甲可以基于重大误解向人民法院或仲裁机构申请撤销该买卖合同，并要求乙返还已支付的价款及赔偿因此遭受的损失。
综上所述，协议书存在重大误解时，当事人应首先确认是否构成重大误解，然后及时采取协商解决、行使撤销权或要求赔偿损失等措施来维护自身权益。在整个过程中，保留证据、了解法律程序和及时咨询都是非常重要的。