政府工程已定案但复核发现问题，应通过以下程序处理，具体分情况说明：
先明确“复核发现问题”的性质
复核发现的问题可能是程序性瑕疵（如审批手续不全、公示期不足）、实体性错误（如工程量计算错误、资质造假），或涉及违法违规（如围标串标、贪污受贿）。不同性质的问题，处理方式完全不同。
- 若是程序性瑕疵：若不影响工程实质合法性（如公示期少1天但无实际损害），可通过补正手续解决；若影响实质合法性（如未按规定招标），则可能需推翻原定案结果。
- 若是实体性错误：需重新核算工程量、审核资质文件，必要时委托第三方机构鉴定，根据结果调整工程价款或责任划分。
- 若是违法违规：需立即移交纪检监察或司法机关，同时暂停工程款支付、追究相关人员责任。
根据问题阶段选择处理路径
- 若工程尚未竣工：可暂停施工，要求整改；若问题严重（如主体结构不合格），可要求拆除重建，并追究施工单位、监理单位责任。
- 若工程已竣工但未验收：可拒绝验收，要求返工或赔偿；若已验收但问题在质保期内，可要求施工单位免费维修。
- 若工程已交付使用：仍可追溯责任，但需注意诉讼时效（一般为3年，自知道权利受损之日起算）；若涉及公共安全（如桥梁裂缝），可要求政府启动应急程序，同时追究责任方民事、行政甚至刑事责任。
关键操作步骤
- 固定证据：立即收集复核报告、原始招标文件、合同、施工记录等材料，避免证据灭失。
- 提出异议：向定案机关（如财政局、审计局）提交书面异议，明确问题及依据，要求重新审查。
- 申请行政复议或诉讼：若定案机关拒绝纠正，可在60日内申请行政复议，或6个月内直接提起行政诉讼（注意：政府工程定案通常属行政行为，需通过行政救济途径解决）。
- 追究责任：若发现工作人员渎职，可向纪委监委举报；若涉及犯罪（如受贿），可向公安机关报案。
提示：政府工程定案后复核发现问题，处理需兼顾“合法性”与“公共利益”。例如，若问题仅涉及轻微程序瑕疵但工程已投入使用，强行推翻可能导致公共资源浪费，此时更可能通过协商补偿解决；若问题严重威胁公共安全，则必须严格追责。具体操作需结合问题细节、证据情况及当地政策，建议直接向我提供更多信息（如问题类型、工程阶段等），以便进一步分析。