结论：可以先打行政官司确认拆迁协议的有效性，之后再就赔偿问题另行起诉，但需注意诉讼时效、证据收集以及案件具体情况等因素。

分析说明：

1. 诉讼程序上的可行性：

   • 在法律上，一个案件的审理并不妨碍另一个相关案件的提起。因此，如果您的朋友认为拆迁协议存在无效或可撤销的情形（如欺诈、胁迫、重大误解等），他完全可以先就协议的有效性提起行政诉讼。
   • 一旦法院确认了协议的有效性或无效性，这将对后续的赔偿问题产生直接影响。如果协议被确认无效，那么赔偿问题就需要根据无效后的法律后果来重新确定；如果协议被确认有效，那么赔偿问题则应按照协议中的约定或相关法律规定来处理。

2. 诉讼时效的考虑：

   • 需要注意的是，无论是确认协议有效性的诉讼还是赔偿诉讼，都受到诉讼时效的限制。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。因此，您的朋友需要在知道或应当知道权利受到损害之日起三年内提起诉讼。
   • 如果先提起确认协议有效性的诉讼，可能会在一定程度上“中断”赔偿诉讼的诉讼时效，但具体是否中断以及中断的效力如何，需要根据案件的具体情况和法院的判断来确定。

3. 证据收集与准备：

   • 在提起任何诉讼之前，证据的收集与准备都是至关重要的。对于确认协议有效性的诉讼，您的朋友需要收集能够证明协议存在无效或可撤销情形的证据；对于赔偿诉讼，他则需要收集能够证明自己遭受了损失以及损失大小的证据。
   • 如果两个诉讼分开进行，那么证据的收集与准备就需要分别进行，这可能会增加一些工作量和成本。但如果能够在一个诉讼中同时解决两个问题（如通过反诉或合并审理等方式），则可能会更加高效和经济。

4. 案件具体情况的影响：

   • 每个案件都有其独特的事实和法律背景，因此具体的诉讼策略也需要根据案件的具体情况来确定。例如，如果拆迁协议中已经明确约定了赔偿方式和标准，且该约定并不违反法律法规的强制性规定，那么先确认协议的有效性可能更为合理；如果协议中并未明确约定赔偿问题或约定不明确，那么可能需要先就赔偿问题进行协商或调解，协商不成再提起诉讼。

行动建议：

• 咨询专业律师：虽然我已经提供了一些基本的法律分析和建议，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，我建议您朋友尽快咨询一位专业律师，以便根据案件的具体情况制定更为详细和有效的诉讼策略。
• 及时收集证据：无论选择哪种诉讼策略，证据的收集与准备都是至关重要的。因此，我建议您朋友尽快开始收集相关证据，并妥善保管好这些证据。
• 关注诉讼时效：不要忘记关注诉讼时效的问题。确保在知道或应当知道权利受到损害之日起三年内提起诉讼，以免丧失胜诉权。

如果您朋友在拆迁问题上还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。