投标保证金凭证一般由收取保证金的招标人或其委托的招标代理机构来开具。以下是对这一问题的详细分析：
一、法律背景与依据
在招投标活动中，投标保证金是投标人按照招标文件的要求向招标人出具的，以一定金额表示的投标责任担保。其目的是确保投标人在投标有效期内不撤回投标文件，中标后能够按照招标文件和投标文件的约定与招标人签订合同，并履行合同义务。关于投标保证金的凭证开具，虽然具体的法律法规可能并未直接规定必须由哪一方开具，但根据招投标活动的常规做法和逻辑，可以合理推断出应由收取保证金的主体来开具。
二、实际操作中的情况
招标人开具：
- 在大多数情况下，招标人会直接收取投标保证金，并因此负责开具相应的凭证。这个凭证通常作为投标人已缴纳保证金的证明，用于后续的投标评审、中标通知等环节。
招标代理机构开具：
- 如果招标人委托了招标代理机构进行招投标活动，那么招标代理机构可能会代表招标人收取投标保证金，并开具相应的凭证。在这种情况下，招标代理机构的行为视为招标人的行为，其开具的凭证同样具有法律效力。
三、凭证的内容与形式
投标保证金凭证通常应包含以下内容：
- 投标人的名称、联系方式等基本信息；
- 保证金的金额、缴纳方式、缴纳时间等详细信息；
- 招标人或招标代理机构的名称、联系方式、收款账户等信息；
- 凭证的开具日期、有效期等时间信息；
- 其他可能需要包含的信息，如招标项目的名称、编号等。
凭证的形式可以是纸质版，也可以是电子版，具体取决于招标文件的要求和实际操作的需要。
四、法律建议与注意事项
确保凭证的真实性与合法性：
- 投标人在收到投标保证金凭证后，应仔细核对凭证上的信息是否准确无误，并确认其真实性和合法性。如有任何疑问或发现异常情况，应及时与招标人或招标代理机构联系并核实。
妥善保管凭证：
- 投标保证金凭证是投标人参与招投标活动的重要证明文件之一，应妥善保管以备后续使用。在投标有效期内或合同履行期间，如需使用该凭证进行证明或索赔等操作时，应能够及时提供。
关注凭证的有效期：
- 投标保证金凭证通常会有一定的有效期限制。投标人应在有效期内使用该凭证进行相关操作，并关注其到期时间以避免因过期而失效。
如果您在招投标活动中遇到任何与投标保证金凭证相关的问题或纠纷，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议和帮助。