结论：团体意外险的理赔，单位不配合时保险公司仍可能赔付，但单位的不配合可能影响理赔流程的推进或赔付效率。具体需分情况讨论。

1. 单位不配合，但被保险人（员工）已按要求提交理赔材料
   团体意外险的理赔主体是员工（被保险人），而非单位。若员工已按保险合同要求提交完整理赔材料（如事故证明、医疗单据等），保险公司应依据合同约定进行审核并赔付。此时，单位的不配合（如未协助提供材料、未盖章确认等）通常不构成保险公司拒赔的合法理由，但可能因材料缺失导致理赔延迟。
   建议：员工可自行收集并提交材料，同时保留与单位沟通的证据（如邮件、聊天记录），若保险公司以“单位未配合”为由拒赔，可主张保险公司履行合同义务。

2. 单位未履行合同义务（如未按时缴费、未如实告知员工信息）导致理赔受阻
   若单位作为投保人未履行合同义务（如未按时缴纳保费、未如实告知员工职业风险等），保险公司可能依据合同条款拒赔或减少赔付。此时，单位的不配合直接影响理赔结果，但员工仍可尝试通过法律途径主张权益。
   建议：员工可要求单位提供缴费凭证、投保单等材料，证明单位已履行义务；若单位存在过错，可向劳动监察部门投诉或通过诉讼要求单位承担赔偿责任。

3. 单位与保险公司存在纠纷，导致理赔被拖延
   若单位与保险公司因合同条款、保费支付等问题产生纠纷，保险公司可能以“争议未解决”为由暂缓理赔。此时，员工虽非纠纷方，但可能因“牵连效应”受影响。
   建议：员工可要求保险公司出具书面说明，明确拒赔或延迟理赔的具体原因；若保险公司无正当理由拖延，可向银保监会投诉或通过诉讼主张权益。

总结：单位不配合是否影响理赔，需结合具体情形判断。员工应优先按保险合同要求提交材料，保留与单位、保险公司的沟通记录，并在必要时通过法律途径维护权益。若您遇到具体问题，可直接向我咨询，我会结合您的实际情况提供详细建议。