在支付令发出后，如果对方提出书面异议，支付令将自行失效，此时申请人需要重新起诉，法院不会直接转入审理程序。以下是对此问题的详细解释：

一、支付令的基本概念与程序

支付令是人民法院根据债权人的申请，依法作出的督促债务人为一定给付义务的法律文书。根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，债权人请求债务人给付金钱、有价证券，符合一定条件的，可以向有管辖权的基层人民法院申请支付令。法院在受理申请后，会进行审查，认为符合条件的，会在受理申请之日起十五日内向债务人发出支付令；认为不符合条件的，会裁定予以驳回。

二、债务人提出书面异议的后果

债务人在收到支付令后，有权在法定期限内（通常是十五日内）提出书面异议。如果债务人提出了有效的书面异议，支付令将自行失效。这里的“自行失效”意味着支付令不再具有法律效力，债权人不能依据支付令直接要求债务人履行义务。

三、申请人需要重新起诉

由于支付令已经失效，债权人若想继续追讨债务，就需要通过诉讼程序来解决。此时，申请人（即债权人）需要向有管辖权的人民法院提起民事诉讼，由法院对案件进行审理并作出判决。在诉讼过程中，申请人需要提供充分的证据来证明自己的债权主张，并承担举证责任。

四、法院不会直接转入审理程序的原因

支付令程序与诉讼程序是两种不同的法律程序，它们各自有独立的适用条件和程序规则。支付令程序是一种非讼程序，旨在通过法院的督促作用，快速、便捷地解决债务纠纷。而诉讼程序则是一种更为正式、严格的法律程序，需要双方当事人进行充分的举证、质证和辩论。因此，当支付令因债务人提出书面异议而失效后，法院不会直接转入诉讼程序的审理阶段，而是需要申请人重新提起诉讼，由法院按照诉讼程序进行审理。

五、建议与注意事项

1. 及时准备诉讼材料：在支付令失效后，申请人应及时准备诉讼材料，包括起诉状、证据材料等，以便尽快向法院提起诉讼。
2. 注意诉讼时效：在提起诉讼时，申请人需要注意诉讼时效的问题。根据《中华人民共和国民法典》的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。因此，申请人应在诉讼时效期间内提起诉讼，否则可能会丧失胜诉权。
3. 寻求专业法律帮助：由于诉讼程序涉及复杂的法律问题和程序规则，申请人可以寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到充分保护。

如果您在支付令或诉讼程序方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。