经济补偿金的计算基数是应发工资，而非实发工资。以下是对这一问题的详细分析：
一、法律依据
根据《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十七条的明确规定：“劳动合同法第四十七条规定的经济补偿的月工资按照劳动者应得工资计算，包括计时工资或者计件工资以及奖金、津贴和补贴等货币性收入。” 这一规定确保了经济补偿金能够全面、真实地反映劳动者的劳动报酬水平以及用人单位的实际劳动力成本，从而有效保障劳动者的合法权益。
二、应发工资与实发工资的区别
应发工资：指劳动者在提供了正常劳动的情况下，用人单位按照约定应当支付给劳动者的工资报酬总额。这个总额中包含了计时工资或计件工资，以及奖金、津贴、补贴等所有货币性收入。换句话说，应发工资是劳动者理论上应该获得的全部收入，它还没有扣除如个人所得税、社会保险费个人缴纳部分等各类应由个人承担的费用。
实发工资：这是劳动者实际拿到手的工资数额，它是在应发工资的基础上扣除了相关费用后的金额。因此，实发工资并不能真实反映劳动者的全部劳动报酬。
三、经济补偿金为何以应发工资为计算基数
选择应发工资作为经济补偿金的计算基数，是因为它能更全面、真实地反映劳动者在正常工作期间的实际劳动报酬水平。如果以实发工资作为计算基数，将会低估劳动者的实际收入水平，进而损害其合法权益。例如，一个劳动者月应发工资为8000元，但每月需扣除社保、公积金及个人所得税等共1000元，实发工资为7000元。在计算经济补偿金时，若以实发工资为准，则显然未能充分保障劳动者的权益；而以应发工资8000元作为计算基数，则更符合法律法规的精神和劳动者的实际利益。
四、特殊情况的处理
月工资低于当地最低工资标准：如果劳动者在劳动合同解除或终止前12个月的平均工资低于当地最低工资标准，那么经济补偿金的计算将按照当地最低工资标准进行。
工作不满12个月：如果劳动者工作不满12个月，则按照实际工作的月数来计算平均工资。
高收入劳动者：对于月工资高于所在地区上年度职工月平均工资三倍的劳动者，经济补偿金按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付年限最高不超过十二年。
五、实际操作建议
在实际操作中，用人单位和劳动者都应明确经济补偿金的计算基数是应发工资。用人单位在计算经济补偿金时，应严格按照法律法规的规定执行，确保劳动者的经济利益得到切实保障。劳动者在签订劳动合同时，也应仔细阅读合同条款，了解自己的权益和义务，以便在劳动合同解除或终止时能够维护自己的合法权益。
综上所述，经济补偿金的计算基数是应发工资，这一规定不仅符合法律法规的要求，也充分体现了对劳动者合法权益的保护。如果你还有其他关于劳动纠纷的问题，可以直接向我咨询。