双倍工资赔偿的计算基数，通常是应发工资而非实发工资。以下是对这一问题的详细解释：

一、应发工资与实发工资的区别

1. 应发工资：指的是劳动者在正常工作时间内，按照劳动合同约定或国家规定应当获得的全部劳动报酬，包括基本工资、奖金、津贴、补贴等各项收入。
2. 实发工资：则是劳动者实际收到的工资，它通常是在应发工资的基础上，扣除了社会保险费、住房公积金、个人所得税等费用后的金额。

二、双倍工资赔偿的计算依据

在劳动纠纷中，当用人单位未与劳动者签订书面劳动合同，或者未按照法律规定支付劳动报酬时，劳动者有权要求用人单位支付双倍工资作为赔偿。这一赔偿的计算基数，通常是劳动者的应发工资。

1. 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。这里的“二倍工资”，指的是以应发工资为计算基数的双倍。
2. 实践操作：在司法实践中，法院或劳动仲裁机构在裁决双倍工资赔偿时，通常会以劳动者的应发工资作为计算基数。这是因为应发工资更能反映劳动者在正常工作时间内应当获得的全部劳动报酬，而实发工资则可能因各种扣除而低于应发工资，从而无法准确反映劳动者的实际劳动价值。

三、特殊情况下的处理

虽然双倍工资赔偿的计算基数通常是应发工资，但在某些特殊情况下，也可能会有所不同。例如：

1. 加班工资：如果劳动者的应发工资中包含了加班工资，而在计算双倍工资赔偿时，是否应将加班工资纳入计算基数，可能需要根据具体情况和当地法律法规进行判断。一般来说，如果加班工资是劳动者正常工作时间的延伸劳动所得，那么它应当被纳入计算基数。
2. 奖金、津贴等：对于奖金、津贴等收入，如果它们是劳动者正常工作时间内应当获得的固定收入，那么它们也应当被纳入双倍工资赔偿的计算基数。

四、建议与注意事项

1. 保留证据：劳动者在要求用人单位支付双倍工资赔偿时，应当保留好相关证据，如工资条、劳动合同、工作记录等，以便在发生纠纷时能够证明自己的权益。
2. 及时咨询：如果劳动者对双倍工资赔偿的计算基数或相关法律法规有疑问，建议及时咨询专业律师或劳动仲裁机构，以获取准确的法律意见和帮助。

综上所述，双倍工资赔偿的计算基数通常是应发工资而非实发工资。劳动者在要求用人单位支付双倍工资赔偿时，应当了解自己的权益和计算依据，并保留好相关证据以便在发生纠纷时能够维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。