核心结论：主人有权要求对方停止侵害、恢复原状、赔偿损失，可通过协商、调解、诉讼等途径解决。以下是具体分析：

1. 法律定性：根据《民法典》物权编及侵权责任编相关规定，自留地属于农民的合法财产，受法律保护。未经允许在他人自留地建坟，构成对土地所有权的侵害（物权法第240条），同时可能违反《殡葬管理条例》中关于墓地选址需经审批的规定，属于违法行为。

2. 权利主张路径：

   • 协商解决：可先与对方沟通，要求其限期迁走坟墓并恢复土地原状。此方式成本最低，但需注意保留书面沟通记录（如短信、录音）。
   • 行政投诉：向当地民政部门或自然资源部门举报，要求行政机关责令对方整改。根据《殡葬管理条例》第20条，违规建坟可处1000元以下罚款。
   • 民事诉讼：若协商、行政途径无效，可向法院起诉，主张：
     • 停止侵害（迁走坟墓）
     • 恢复原状（平整土地）
     • 赔偿损失（如土地无法耕种期间的收益损失）

3. 关键证据收集：

   • 土地权属证明（如承包经营权证）
   • 现场照片、视频（显示坟墓位置及土地现状）
   • 沟通记录（证明已主张权利）
   • 损失评估报告（如农业收益减少证明）

4. 特殊情形处理：

   • 若对方是亲属且经济困难，可考虑通过人民调解委员会协商补偿方案，但需签订书面协议。
   • 若涉及历史遗留问题（如坟墓已存在多年），需结合当地风俗习惯，但法律上仍以土地权属为准。

建议行动步骤：

1. 立即固定证据（拍照、录像）
2. 向村委会/居委会提交书面异议
3. 同步向当地民政部门投诉
4. 若30日内未解决，委托律师起草律师函或直接起诉

如需进一步帮助，可提供具体细节（如土地性质、建坟时间等），我将为您制定更详细的维权方案。