在按基础合同起诉后，票据的处理方式需结合具体案情和诉讼策略综合判断，以下是分情况说明：

1. 票据作为基础合同履行的证据
   若票据（如汇票、本票）是基础合同（如买卖合同、借款合同）的付款凭证，起诉时可将其作为证据提交，证明合同履行情况或债权金额。此时票据本身不单独成为诉讼标的，但需注意：

   • 票据真实性：需提供票据原件或经公证的复印件，证明其与基础合同的关联性（如票据金额、日期与合同约定一致）。
     
   • 票据状态：若票据已承兑或付款，需在诉状中明确扣除已支付部分；若票据被拒付（如遭退票），可同时主张票据追索权与基础合同债权（需符合《票据法》第18条“利益返还请求权”或第61条“追索权”条件）。

2. 票据纠纷与基础合同纠纷竞合时的处理
   若票据权利（如付款请求权）与基础合同权利（如货款请求权）产生竞合，原告需选择其一主张：

   • 选择票据权利：以《票据法》为依据，起诉票据的出票人、背书人或承兑人，要求支付票据金额。此时需提交票据原件、拒付证明（如退票理由书）等材料。
     
   • 选择基础合同权利：以《民法典》合同编为依据，起诉合同相对方，要求履行付款义务。此时票据可作为辅助证据，但诉讼标的为合同债权，而非票据权利。
     
   • 注意：根据《票据法》第13条，若基础合同存在抗辩事由（如货物质量问题），票据债务人可对抗票据权利人，但需在诉讼中主动主张。

3. 票据已流转至第三人时的处理
   若票据已通过背书转让至善意第三人，基础合同当事人可能丧失票据权利，此时需分情况处理：

   • 若第三人符合善意取得条件（如支付对价、不知存在抗辩事由），基础合同债权人仅能依据合同向债务人主张权利，无法通过票据追索。
     
   • 若第三人存在恶意（如明知债务人无权处分票据），可依据《民法典》第311条主张返还票据，或直接起诉债务人违约。

4. 诉讼中票据的保全与执行

   • 诉前/诉讼保全：若担心票据被转移或兑付，可向法院申请冻结票据权利（如要求承兑人暂停付款），需提供担保并符合《民事诉讼法》第104条条件。
     
   • 执行阶段：若胜诉后债务人未履行，可申请强制执行票据权利（如要求承兑人付款），或拍卖、变卖票据（若票据具有财产价值）。

建议：票据处理需结合基础合同性质、票据类型及流转情况综合判断。若涉及复杂票据流转或抗辩事由，建议提供票据原件、合同文本及交易记录等材料，以便进一步分析诉讼策略。如有具体案情，可直接向我咨询。