施工合同约定的条款若违反法律规定，通常应当认定该条款无效。以下从不同角度进行详细分析：
一、违反法律法规强制性规定的条款无效
根据《中华人民共和国民法典》第一百五十三条的规定，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。在建设工程施工合同中，如果合同条款违反了建筑法、招投标法等相关法律法规的强制性规定，如约定施工企业无需资质等级、未经招投标程序直接签订合同等，这些条款将因违反法律法规的强制性规定而被认定为无效。
举例：若施工合同中约定施工企业无需具备相应的资质等级即可承接工程，这一条款明显违反了《建筑法》中关于施工企业资质管理的强制性规定，因此该条款无效。
二、条款无效不影响合同其他部分的效力（特殊情况）
虽然合同中的某些条款可能因违反法律规定而被认定为无效，但这并不意味着整个合同都无效。根据《民法典》的相关规定，合同部分无效，不影响其他部分效力的，其他部分仍然有效。在建设工程施工合同中，如果无效条款不涉及合同的核心内容，如工程价款、建设工期等，且其他条款符合法律规定，那么这些有效条款仍然具有法律效力。
举例：若施工合同中除了违反资质管理的条款外，还包含了关于工程价款、建设工期、质量标准等合法有效的条款，那么这些条款在合同无效的情况下仍然具有法律效力，双方应依约履行。
三、条款无效后的法律后果
返还财产：如果因无效条款导致一方获得了不当利益，受损方有权要求返还财产。在建设工程施工合同中，如果因无效条款导致发包人支付了不应支付的工程款，承包人应返还该部分款项。
赔偿损失：因无效条款给一方造成损失的，过错方应承担赔偿责任。在建设工程施工合同中，如果因承包人违反资质管理规定导致合同无效，并给发包人造成损失的，承包人应承担相应的赔偿责任。
重新协商或诉讼/仲裁：合同无效后，双方可以重新协商签订新的合同，或者根据合同中的争议解决条款（如仲裁条款）通过诉讼或仲裁方式解决纠纷。
四、实际操作建议
审查合同条款：在签订建设工程施工合同时，双方应仔细审查合同条款，确保不违反法律法规的强制性规定。特别是关于施工企业资质、招投标程序、工程价款结算等关键条款，应严格遵守相关法律法规的规定。
咨询专业律师：虽然我在这里已经给出了详细的法律解释和建议，但每个具体案件都有其独特性和复杂性。因此，在签订和履行建设工程施工合同过程中，如果遇到任何法律问题或疑虑，建议直接向我咨询，以便获得更具体、更专业的法律意见。
保留证据：在合同履行过程中，双方应妥善保留与合同相关的所有证据和文件，如合同文本、支付凭证、验收报告等。这些证据和文件在解决纠纷时将起到至关重要的作用。
综上所述，施工合同约定的条款若违反法律规定，通常应当认定该条款无效。但具体案件的处理还需根据合同的具体内容、无效条款的性质以及双方的过错程度等因素进行综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。