医疗损害司法鉴定的费用承担主体需根据具体情况确定，通常由申请方预付，最终责任归属依据鉴定结果和法律规定判定。以下是对不同情况下的详细分析：

一、一般原则

1. 谁主张，谁举证：在医疗纠纷中，通常遵循“谁主张，谁举证”的原则。这意味着，如果一方（通常是患者或其家属）认为医疗机构存在过错并导致损害，那么这一方有责任提供证据来证明其主张。因此，在大多数情况下，提出医疗损害鉴定申请的一方需要先行支付鉴定费用。

2. 败诉方承担：如果法院最终判决医疗机构承担责任，那么鉴定费用可能会由医疗机构承担。这取决于具体的法律程序和法院的判决结果。

二、具体情形下的费用承担

1. 双方共同委托：

   • 经医患双方当事人共同委托进行医疗损害鉴定的，鉴定费一般由双方当事人协商预交比例，或各自预交一半。
   • 若最终鉴定意见支持患方的诉求，鉴定费可能主要由医方承担；反之，则可能由患方承担。

2. 卫生行政部门移交：

   • 卫生行政部门移交进行医疗事故技术鉴定的，鉴定费由提出医疗事故争议处理的当事人预先缴纳。
   • 若属于医疗事故的，鉴定费由医疗机构支付；不属于医疗事故的，则由提出医疗事故争议处理申请的当事人支付。

3. 诉讼中的鉴定：

   • 在诉讼过程中，若法院认为需要进行医疗损害鉴定，鉴定费一般由申请鉴定的一方先行垫付。
   • 待案件审理结束后，法院会根据判决结果决定鉴定费用的最终承担者。例如，若医院被认定存在过错并承担赔偿责任，则鉴定费可能由医院承担。

4. 重新鉴定：

   • 若对首次鉴定结论不服并提出再次鉴定申请，无论鉴定结论是否一致，重新鉴定费用均由申请人承担。
   • 但若因鉴定机构或鉴定人的原因导致鉴定结论错误，相关费用应由该机构或个人承担。

5. 其他特殊情形：

   • 若医疗机构主动申请鉴定以证明自身无过错，且鉴定结果支持其主张，则鉴定费由医疗机构自行承担。
   • 在涉及第三方责任（如医疗器械质量问题）的案件中，鉴定费可能根据责任划分由多方分担。

三、法律依据

根据《医疗事故处理条例》第三十四条的规定：“医疗事故技术鉴定，可以收取鉴定费用。经鉴定，属于医疗事故的，鉴定费用由医疗机构支付；不属于医疗事故的，鉴定费用由提出医疗事故处理申请的一方支付。鉴定费用标准由省、自治区、直辖市人民政府价格主管部门会同同级财政部门、卫生行政部门规定。”

四、建议

鉴于医疗损害司法鉴定费用的承担问题复杂多变，且涉及多方责任与义务分配，建议当事人在启动鉴定程序前务必咨询专业律师，以明确具体的法律规定、操作流程及可能的费用承担情况。同时，各方应保持沟通与合作，力求在尊重法律的基础上，通过协商解决争议，降低不必要的法律成本与风险。

希望以上分析能对你有所帮助。如果你还有其他关于医疗医患（事故责任及赔偿）的问题，欢迎直接向我咨询。