结论：到部队后查出曾有刑事犯罪但情节较轻不予起诉，是否会被退兵需根据具体情况判断，一般来说存在被退兵的可能性，但也并非绝对。以下从不同角度为你详细分析：

从部队征兵政策及纪律要求角度

部队对于新兵的政治素质和品德要求极为严格，旨在确保部队的纯洁性和战斗力。曾有刑事犯罪记录，即便情节较轻且不予起诉，这在一定程度上反映出该人员过去存在违反法律规范的行为。部队在审查新兵情况时，会全面考量其过往经历，这种有犯罪记录的情况很可能不符合部队对于新兵政治可靠、品德良好的基本要求，从而成为退兵的一个因素。例如，在一些对政治素质要求极高的特殊兵种选拔中，对于此类情况可能会采取更为严格的标准，直接作出退兵决定。

从不予起诉的法律性质及影响角度

不予起诉并不等同于无罪认定，它只是检察机关根据案件具体情况，认为犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚而作出的决定。这意味着该人员确实存在违法犯罪行为，只是情节较轻未达到起诉标准。这种法律上的认定会在个人档案中留下记录，部队在政审环节能够查询到相关信息。部队为了维护自身的纪律性和严肃性，对于有违法犯罪记录的人员会持谨慎态度，有可能会因此决定退兵。不过，如果该不予起诉的情况是因为一些特殊原因，如年龄小、初犯且情节显著轻微等，部队也可能会综合考虑其他因素，不直接作出退兵决定。

从实际处理案例及部队酌情考量角度

在实际操作中，部队会根据具体情况进行酌情处理。如果该人员在不予起诉后，能够积极改正错误，有良好的表现和积极向上的生活态度，且在入伍前向部队如实说明了情况，部队可能会综合考虑这些因素，给予其改过自新的机会，不进行退兵处理。例如，有的新兵在年少时因一时冲动犯了轻微犯罪，不予起诉后深刻反思，努力学习、工作，积极为社会做贡献，在入伍时如实告知部队自己的过往，部队可能会认可其改过自新的态度，允许其继续留在部队服役。但如果该人员隐瞒了自己的不予起诉情况，在部队查出后，这种不诚实的行为会进一步加重部队对其的负面评价，退兵的可能性就会大大增加。

建议：如果你面临这种情况，首先要如实向部队说明自己的过往情况，不要隐瞒，展现出诚恳的态度。同时，要积极表现，遵守部队的各项规章制度，用实际行动证明自己已经改正错误，有能力成为一名合格的军人。如果对退兵决定存在异议，也可以通过合法的途径，如向相关部门申诉等方式来维护自己的合法权益。如果你还有其他关于刑事案件或部队相关法律问题，都可以直接向我咨询。