结论前置：在劳动合同中，关于甲方（用人单位）拖欠工资时，双方约定违约金的合法范围并非由双方自由约定，而是受到法律的严格限制。通常情况下，劳动合同中不得直接约定由劳动者承担因用人单位拖欠工资的违约金。不过，若用人单位存在拖欠工资等违法行为，劳动者有权要求用人单位支付赔偿金，其合法范围为应付金额的百分之五十以上百分之一百以下。
一、法律原则与限制
违约金约定的限制：
- 根据《劳动合同法》的相关规定，劳动合同中关于违约金的约定受到严格限制。仅在服务期约定和竞业限制约定两种特定情形下，用人单位可与劳动者约定由劳动者承担违约金。其他情况下，任何关于工资违约金的约定均属无效。
赔偿金的合法范围：
- 当用人单位未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬时，根据《劳动合同法》第八十五条的规定，用人单位需承担法律责任。具体而言，若用人单位逾期不支付劳动报酬，劳动行政部门将责令其支付，并按应付金额的百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金。
二、具体情形分析
拖欠工资的赔偿金计算：
- 计算公式：赔偿金 = 应付金额 × 赔偿比例（50%-100%）
- 实例说明：假设劳动者应得工资为10000元，用人单位拖欠未支付。若劳动行政部门责令用人单位支付，并决定按应付金额的80%加付赔偿金，则用人单位需额外支付8000元作为赔偿金。
服务期与竞业限制违约金的例外：
- 尽管在拖欠工资的情形下，劳动者通常不承担违约金，但在服务期约定和竞业限制约定中，若劳动者违反约定，则需承担相应的违约金。然而，这些违约金的数额也受到法律的严格限制，如服务期违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用，且需按未履行部分分摊计算。
三、实践建议
对于劳动者：
- 在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于违约金和赔偿金的约定。若发现用人单位试图在合同中约定不合理的违约金条款，应及时提出异议并寻求法律帮助。
- 若遭遇用人单位拖欠工资等违法行为，应及时向劳动行政部门投诉，并保留好相关证据，以便在后续的法律程序中维护自己的合法权益。
对于用人单位：
- 应严格遵守《劳动合同法》等相关法律法规的规定，及时足额支付劳动者的劳动报酬，避免引发法律纠纷。
- 在约定服务期和竞业限制条款时，应确保违约金的数额合理且符合法律规定，避免因约定不当而承担法律责任。
四、法律后果
- 若用人单位在劳动合同中违法约定由劳动者承担拖欠工资的违约金，该条款将被视为无效。劳动者有权拒绝支付该违约金，并有权要求用人单位支付拖欠的工资及相应的赔偿金。
- 若劳动者因用人单位拖欠工资而提起劳动仲裁或诉讼，且仲裁机构或法院认定用人单位存在违法行为，用人单位将需承担支付拖欠工资、赔偿金及可能的其他法律责任（如滞纳金、罚款等）。
总结：在劳动合同中，关于甲方拖欠工资时违约金的合法范围受到法律的严格限制。通常情况下，劳动者不承担因用人单位拖欠工资的违约金。然而，若用人单位存在违法行为，劳动者有权要求用人单位支付赔偿金。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。