结论：网贷逾期协商只还本金后，若还完显示不是“已结清”，可能涉及多种情况，包括协商内容未明确、平台操作问题、合同条款限制或存在其他费用等。以下是对这些情况的详细分析：

1. 协商内容未明确：

   • 在协商过程中，可能双方并未就“还完本金后即视为结清”这一条款达成明确共识。如果协商时仅口头约定只还本金，而未形成书面协议或明确记录在还款计划中，那么平台在系统操作上可能仍会按照原合同执行，即认为仍有未结清的款项（如利息、罚息等）。
   • 建议：确保在协商过程中，所有条款都以书面形式明确记录，并双方签字确认。这样，在还款完成后，可以依据书面协议要求平台更新还款状态。

2. 平台操作问题：

   • 有时候，即使协商成功并还清了本金，由于平台系统更新延迟或操作失误，还款状态可能未能及时更新为“已结清”。
   • 建议：及时与平台客服联系，提供还款凭证，要求平台核实并更新还款状态。如果平台拒绝更新或拖延处理，可以考虑向相关监管部门投诉或寻求法律援助。

3. 合同条款限制：

   • 某些网贷合同中可能包含特定条款，如“即使提前还款，仍需支付部分利息或罚息”等。如果协商时未对这些条款进行修改或豁免，那么即使还清了本金，也可能因合同条款的限制而无法立即结清。
   • 建议：仔细审查原合同条款，了解是否存在此类限制。如果存在，可以尝试与平台进一步协商，看是否能够达成新的协议以豁免这些费用。

4. 存在其他费用：

   • 除了本金外，网贷还可能涉及利息、罚息、违约金、服务费等多种费用。如果协商时仅针对本金进行了减免或豁免，而未涉及其他费用，那么即使还清了本金，也可能因其他费用的存在而无法结清。
   • 建议：在协商过程中，明确询问并确认是否需要支付其他费用。如果平台要求支付其他费用，可以尝试进一步协商减免或豁免。如果协商无果，且认为这些费用不合理或违法，可以考虑通过法律途径解决。

额外提醒：在处理网贷逾期问题时，务必保持谨慎和理性。不要轻信非正规渠道的“快速结清”或“减免债务”等承诺，以免陷入更深的债务困境。同时，建议定期查询个人征信报告，了解自己的信用状况，及时发现并处理可能存在的问题。

后续行动建议：如果上述情况均已排除，但还款状态仍未更新为“已结清”，建议采取以下措施：

• 再次与平台客服沟通，要求提供详细的还款记录和结清证明；
• 如果平台无法提供满意答复或拒绝更新还款状态，可以向相关监管部门（如银保监会、地方金融监管局等）投诉；
• 如有必要，可以寻求专业律师的帮助，通过法律途径维护自己的合法权益。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。