结论：网贷逾期全部还进去后，三天了还有部分贷款没还清，可能存在多种原因，包括但不限于系统处理延迟、还款金额计算错误、存在未结清的利息或费用、贷款合同中有特殊条款以及存在其他未显示的贷款等。以下是对这些可能原因的详细分析：

1. 系统处理延迟：

   • 解释：在您还款后，银行或网贷平台的系统可能需要一定时间来处理还款信息，更新您的账户状态。这种延迟可能是由于系统繁忙、网络问题或内部处理流程等原因造成的。
   • 建议：您可以先等待一段时间，观察账户状态是否更新。如果长时间未更新，建议您联系银行或网贷平台的客服，确认还款是否已成功处理。

2. 还款金额计算错误：

   • 解释：在还款过程中，可能由于计算错误或输入错误，导致您实际还款金额与应还款金额不符。例如，您可能只还了本金部分，而忽略了利息或罚息部分。
   • 建议：您应仔细核对还款金额，确保与贷款合同或还款计划中的金额一致。如果发现计算错误，应及时联系银行或网贷平台，补足差额。

3. 存在未结清的利息或费用：

   • 解释：除了本金外，贷款合同中可能还规定了利息、罚息、手续费等费用。在您还款时，如果未同时结清这些费用，那么即使本金已还清，贷款账户仍会显示有未结清的余额。
   • 建议：您应仔细阅读贷款合同，了解所有应还款项。在还款时，确保同时结清所有费用，以避免产生不必要的纠纷。

4. 贷款合同中有特殊条款：

   • 解释：某些贷款合同中可能包含特殊条款，如提前还款需支付违约金、还款需按特定顺序进行等。如果您在还款时未遵守这些条款，可能会导致部分贷款未还清。
   • 建议：您应仔细阅读贷款合同中的所有条款，特别是与还款相关的部分。在还款前，确保了解并遵守所有规定，以避免产生额外费用或纠纷。

5. 存在其他未显示的贷款：

   • 解释：您可能同时申请了多笔贷款，而在还款时只还清了其中一笔或部分贷款。因此，即使您认为已还清所有贷款，但实际上仍可能有其他贷款未还清。
   • 建议：您应登录银行或网贷平台的账户，查看所有贷款记录，确保每笔贷款都已还清。如果发现存在未还清的贷款，应及时进行还款。

进一步行动建议：

• 如果您在等待一段时间后，账户状态仍未更新，或您对还款金额、费用等存在疑问，建议您直接联系银行或网贷平台的客服，提供详细的还款记录和贷款合同信息，以便他们协助您解决问题。
• 在处理此类问题时，请保持冷静和耐心，与银行或网贷平台进行积极沟通，共同寻找解决方案。

如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。