当案件已经送到检察院，且取保候审期限已经过后，检察院会根据案件的具体进展以及犯罪嫌疑人在取保候审期间的表现，来依法作出相应的处理决定。以下是一个详细且深入的处理流程分析：
一、审查与决策流程
全面审查：
- 在取保候审期限即将届满时，检察院的案件承办人会对案件进行全面细致的审查。这包括评估案件的侦查、审查起诉的进展情况，以及犯罪嫌疑人在取保候审期间的行为表现，如是否遵守取保候审的规定，是否有新的违法犯罪行为等。
提出意见与决策：
- 基于审查结果，案件承办人会提出具体的处理意见，这可能包括继续取保候审、变更强制措施（如逮捕或监视居住）或解除取保候审。这些意见会依次报部门负责人审核，并最终由检察长作出决定。
二、具体处理方式及程序
解除取保候审：
- 条件：如果犯罪嫌疑人不应当被追究刑事责任，或者取保候审期限已经届满且案件尚未办结但无需继续采取该措施，检察院会决定解除取保候审。
- 程序：检察院会制作《解除取保候审决定书》，并及时通知执行机关（通常是公安机关）及犯罪嫌疑人。执行机关会向犯罪嫌疑人宣读决定书，并要求其在回执上签名或盖章。同时，执行机关会通知被取保候审人居住地的派出所，宣布解除取保候审，并退还保证金（如果已缴纳）。
变更强制措施：
- 条件：如果犯罪嫌疑人仍需采取强制措施，但取保候审已经不适宜，比如犯罪嫌疑人违反了取保候审的规定，可能影响案件的正常侦查或起诉，检察院可以决定变更为其他强制措施，如逮捕或监视居住。
- 程序：检察院作出变更决定后，会将相关法律文书送达执行机关。执行机关会根据新的强制措施类型，依法执行。
继续取保候审：
- 条件：如果案件的侦查、审查起诉工作尚未完成，且犯罪嫌疑人仍然符合取保候审的条件，检察院可以决定继续取保候审。
- 程序：需要重新办理取保候审手续，包括确定新的取保候审期限（最长不超过12个月），并要求犯罪嫌疑人提供新的保证人或交纳保证金。随后，检察院将相关法律文书送达执行机关执行，并告知犯罪嫌疑人继续遵守相关规定。
移送审查起诉与不起诉：
- 移送审查起诉：对于符合起诉条件的案件，检察院在取保候审期满后，会将案件移送至法院进行审查起诉，从而进入审判程序。
- 不起诉：如果检察院经审查认为犯罪嫌疑人的行为不构成犯罪，或者情节显著轻微、危害不大，不需追究刑事责任，将作出不起诉决定，并同时解除取保候审。不起诉决定分为法定不起诉、酌定不起诉和证据不足不起诉三种情况。
三、法律保障与注意事项
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的规定，取保候审的最长期限不得超过12个月。
- 检察院在处理取保候审到期案件时，必须确保程序的合法性，并充分保障被取保候审人的合法权益。
- 被取保候审人在取保候审期间应严格遵守相关规定，如不得离开所居住的市、县，不得干扰证人作证等，否则可能面临强制措施的变更。
综上所述，检察院在取保候审期限过后会根据案件的实际情况和犯罪嫌疑人的表现作出最合理的处理决定。这个过程既严谨又灵活，旨在确保法律的公正性得到充分体现，同时保障被取保候审人的合法权益。