村干部退还强占的集体资金50万元，应按以下步骤依法处理：

1. 确认资金性质与来源
   首先需明确该50万元是否属于村集体经济组织所有（如土地补偿款、集体资产收益等），且村干部是否存在非法侵占、挪用等行为。若资金确属集体所有且被非法占有，退还行为属于主动纠正违法行为，但仍需通过法定程序确认资金归属。

2. 启动财务交接与审计程序

   • 交接手续：村干部应将50万元全额交至村集体账户，并出具书面说明（包括资金来源、占用时间、退还原因等），由村集体负责人签字确认。
     
   • 审计监督：立即联系乡镇政府或农村经济管理部门，委托第三方审计机构对村集体财务进行专项审计，重点核查该笔资金的使用记录、账目往来，确认是否存在其他未退还的侵占款项。

3. 公开透明处理并接受监督

   • 村民会议通报：根据《村民委员会组织法》，村集体应在15日内召开村民会议或村民代表会议，通报资金退还情况、审计结果及后续处理方案，确保村民知情权。
     
   • 公示公告：在村务公开栏或政府指定平台公示资金退还明细、审计报告摘要，公示期不少于7日，接受村民及社会监督。

4. 追究法律责任（如存在违法行为）

   • 行政责任：若村干部存在挪用公款、贪污等行为，即使已退还，仍需由乡镇政府或纪检监察部门依法给予警告、记过等处分。
     
   • 刑事责任：若侵占金额较大（如超过6万元，具体以当地标准为准），可能涉嫌职务侵占罪或贪污罪，需移送司法机关处理。退还行为可作为量刑情节，但不影响犯罪成立。

5. 完善制度防止再次发生

   • 修订村规民约：明确村集体资金管理规则，禁止任何个人擅自占用，规定资金使用需经村民会议或村民代表会议表决。
     
   • 建立监督机制：设立村务监督委员会，定期核查集体财务，对大额资金流动实行“一事一议”制度。

提示：若退还过程中发现村干部存在其他违法行为（如伪造账目、串通侵占等），或村民对处理结果有异议，可进一步向我咨询具体维权路径。