在行政诉讼中，若法官认为被告失格（即被告不适格），法院将依法采取一系列措施以确保诉讼程序的正当性和有效性，具体处理方式如下：
告知原告变更被告：
- 法律依据：根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国行政诉讼法〉的解释》第二十六条，若原告所起诉的被告不适格，人民法院有义务告知原告变更被告。
- 实践应用：例如，在行政处罚案件中，若原告错误地将协助执行机构列为被告，而实际作出处罚决定的是另一行政机关，法院应向原告明确指出适格的被告，并引导其进行变更。若原告同意变更，需提交变更被告的书面申请，说明变更原因和新被告信息，法院将重新安排诉讼程序，且原有诉讼行为在符合法律规定的情况下对变更后的被告继续有效。
原告拒绝变更被告的后果：
- 若原告不同意变更被告，法院将裁定驳回起诉。这是因为缺乏明确的、符合法律规定的相对方，无法形成有效的行政诉讼法律关系。但原告可在法定期限内以适格的被告重新提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。
多个被告情况下的处理：
- 若案件涉及多个应被告知的被告，但原告仅起诉了其中一个，法院亦会告知原告应将所有相关被告均列入诉讼，以确保案件的全面审理。若原告不同意追加被告，法院将通知其以第三人的身份参加诉讼（行政复议机关作共同被告的除外），以保障诉讼的公正性和完整性。
法院依职权追加被告：
- 在某些情况下，如存在必须共同进行诉讼的当事人（如多个行政机关作出同一行政行为而原告仅起诉部分时），根据《行政诉讼法》第二十七条及《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国行政诉讼法〉的解释》第二十九条，法院可依职权追加被告。法院会向被追加被告送达诉讼文书，并通知其他当事人。若原告不同意追加，法院可通知其以第三人身份参加诉讼（行政复议机关作共同被告的除外）。
移送管辖或其他程序性处理：
- 若被告不适格因案件不属于该法院管辖范围，法院可能根据相关规定将案件移送至有管辖权的法院；或根据其他程序性规定作出处理，以确保诉讼程序的合法性和有效性。
法律建议与预防措施：
- 起诉前充分调查：为避免被告不适格导致的诉讼障碍，建议在起诉前充分调查并确认被告的适格性。这包括了解相关法律法规、明确行政行为的具体作出机关以及确认被告的法定职责等。
- 积极配合法院处理：在面临被告不适格问题时，原告应积极配合法院的处理措施，及时变更被告或重新提起诉讼，以维护自身合法权益。
- 寻求专业法律帮助：若对被告适格性存在疑问或不确定如何处理，建议寻求专业律师的帮助，以确保诉讼策略的正确性和有效性。
结论：在行政诉讼中，被告的适格性是诉讼程序合法性的重要基础。面对被告不适格的情况，法院将依法履行释明义务，引导原告变更被告；若原告拒绝变更，则法院将裁定驳回起诉。同时，原告也享有在法定期限内以适格被告重新提起诉讼的法律救济权利。因此，为确保诉讼的成功进行，当事人在起诉前应仔细核实被告的适格性，并在诉讼过程中积极配合法院的处理措施。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。