结论：非法主体劳动争议在劳动关系存续期间超过诉讼时效限制的情况下，劳动者并非完全无法维权，而是需要根据具体情况采取不同的策略。以下是从多个角度对这一问题的详细分析：

1. 诉讼时效的基本规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
   • 如果劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议，劳动者申请仲裁不受上述一年仲裁时效期间的限制；但是，劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。

2. 非法主体劳动争议的特殊性：

   • 非法主体，如未办理营业执照、营业执照被吊销或者营业期限届满仍继续经营的用人单位，与劳动者之间发生的劳动争议，虽然主体不合法，但劳动者的权益仍受法律保护。
   • 在此类争议中，如果劳动者在劳动关系存续期间内未及时主张权利，且超过了法定的诉讼时效期间，那么从法律程序上讲，劳动者可能面临败诉的风险。

3. 超过诉讼时效后的应对策略：

   • 尝试协商和解：尽管超过了诉讼时效，但劳动者仍可以尝试与用人单位进行协商，看是否能够达成和解协议，以维护自己的合法权益。
   • 寻找时效中断或中止的证据：根据法律规定，诉讼时效可以因特定事由而中断或中止。如果劳动者能够找到证据证明在诉讼时效期间内发生了中断或中止的事由（如向用人单位主张权利、用人单位同意履行义务等），那么诉讼时效可能会重新计算或延长。
   • 考虑其他法律途径：如果协商和解无果，且无法找到时效中断或中止的证据，劳动者还可以考虑通过其他法律途径来维护自己的权益，如向劳动监察部门投诉、寻求法律援助等。但需要注意的是，这些途径可能无法直接解决劳动争议本身，而是通过行政或社会力量来促使用人单位履行义务或达成和解。
   • 特殊情况下的诉讼时效延长：在极少数情况下，如果劳动者能够证明自己因不可抗力或其他正当理由无法在诉讼时效期间内提起仲裁或诉讼，那么法院或仲裁机构可能会根据具体情况决定是否延长诉讼时效。但这种情况较为罕见，且需要劳动者提供充分的证据来支持自己的主张。

4. 预防措施与建议：

   • 及时主张权利：劳动者在发现自己的权益受到侵害时，应及时向用人单位主张权利，并保留好相关证据（如书面通知、聊天记录、邮件等）。
   • 了解法律程序：劳动者应了解劳动争议的法律程序和时效规定，以便在必要时及时采取行动。
   • 寻求专业帮助：如果劳动者对法律程序或时效规定不了解，或者遇到复杂的劳动争议问题，可以寻求专业律师的帮助来维护自己的权益。

行动建议：如果你正面临非法主体劳动争议且担心超过诉讼时效的问题，建议你首先尝试与用人单位进行协商和解；如果协商无果，且无法找到时效中断或中止的证据，那么你可以考虑向劳动监察部门投诉或寻求法律援助；同时，你也可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供更详细的法律建议和帮助。