结论：干汽车配件做坏两个罚1000是否违法，不能一概而论，需要结合具体情况来判断，包括罚款的依据、罚款的主体以及罚款的程序等。以下从几个方面进行详细分析：

1. 罚款依据的合法性：

   • 如果罚款是基于双方事先约定的合同条款，且该条款不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么这种罚款可能具有一定的合法性。例如，在雇佣合同或加工承揽合同中，双方约定如果因乙方原因造成产品损坏，乙方需承担一定的赔偿责任或罚款，这种约定在合理范围内是有效的。
   • 如果罚款没有明确的法律依据或合同依据，而是单方面由雇主或管理者决定，那么这种罚款可能缺乏合法性，可能构成对员工或合作方的不当处罚。

2. 罚款主体的合法性：

   • 罚款应当由具有相应权限的主体进行。例如，在劳动关系中，雇主通常没有直接罚款的权力，除非这种权力在劳动合同或公司规章制度中有明确规定，并且这些规定已经过民主程序制定并公示。
   • 如果罚款是由不具有相应权限的主体（如普通员工或非管理层的第三方）进行，那么这种罚款很可能是违法的。

3. 罚款程序的合法性：

   • 即使罚款有合法的依据和主体，罚款的程序也必须合法。例如，应当事先告知被罚款者罚款的原因、依据和金额，并给予其陈述和申辩的机会。
   • 如果罚款程序不合法，如未经告知直接罚款、罚款金额未经双方确认等，那么这种罚款也可能构成违法。

4. 罚款金额的合理性：

   • 罚款金额应当与造成的损失或违约行为相当，不能过高或过低。如果两个汽车配件的损坏导致的实际损失远低于1000元，那么罚款1000元可能显得过高，可能构成对被罚款者的不公平对待。
   • 罚款金额的合理性也需要根据具体情况来判断，包括损坏配件的价值、修复或更换的成本、因损坏导致的其他损失等。

建议：

• 如果你作为被罚款者，认为罚款不合法或不合理，你可以先与罚款方进行沟通协商，尝试解决争议。
• 如果沟通无果，你可以考虑向相关部门（如劳动监察部门、市场监管部门等）投诉或举报，或者寻求法律援助和诉讼途径来维护自己的合法权益。
• 如果你作为罚款方，在实施罚款前，请确保罚款有合法的依据、主体和程序，并且罚款金额合理，以避免不必要的法律纠纷。

可能法律后果：

• 如果罚款被认定为违法或不合理，罚款方可能需要退还罚款金额，并可能面临行政处罚或民事赔偿等法律责任。
• 如果被罚款方因此遭受了其他损失（如名誉损失、精神损失等），罚款方也可能需要承担相应的赔偿责任。