法院会根据《民法典》及相关司法解释的规定，结合双方具体情况，依法对机长起诉离婚的案件进行审理并作出判决，处理方式与普通离婚案件无本质区别，但可能因机长职业特殊性在子女抚养、财产分割等方面有所侧重。具体分析如下：

1. 审理程序
   离婚案件一般适用普通程序审理，若双方争议不大、证据充分，也可能适用简易程序。法院会先组织调解，若调解无效且感情确已破裂（如存在重婚、家暴、分居满2年等法定情形），则判决准予离婚。

2. 子女抚养权归属
   若双方有未成年子女，法院会以“子女利益最大化”为原则判决抚养权。机长因工作性质可能长期飞行、居无定所，法院可能倾向于将子女判给更有利于陪伴、教育的一方（如女方），但若机长能证明其收入稳定、有亲属协助抚养或女方存在不利于抚养的情形（如疾病、不良嗜好），也可能获得抚养权。抚养费一般按机长收入的20%-30%比例支付。

3. 财产分割
   夫妻共同财产原则上均分，但会考虑双方贡献、过错等因素。机长的收入（包括工资、奖金、飞行小时费等）及房产、车辆等财产均属共同财产。若机长能证明部分财产为婚前个人财产（如婚前购买的房产），则不参与分割。若女方存在重大过错（如出轨、转移财产），机长可主张少分或不分财产。

4. 职业特殊性影响
   机长因工作需频繁出差、值夜班，可能影响其对家庭的付出（如照顾子女、家务劳动），法院在判决时可能酌情考虑这一因素，但不会因此直接否定其抚养权或财产分割请求。若机长因飞行任务无法出庭，可委托律师代理或申请延期审理。

建议：若您是机长或其配偶，需准备结婚证、子女出生证明、财产凭证（如房产证、银行流水）、收入证明等材料，并收集能证明感情破裂或对方过错的证据（如聊天记录、照片、证人证言）。如有需要，可进一步向我咨询具体操作流程。