关于“卖淫嫖娼指认老板是否会查出来”的问题，结论是：指认老板后，公安机关一般会进行调查，但能否查实并定罪取决于证据的充分性和合法性。以下从多个角度详细分析：

1. 指认的法律效力

• 指认的性质：指认属于证人证言的一种形式，是公安机关侦查案件的重要线索。根据《刑事诉讼法》第五十条，证人证言是法定证据种类之一，但需经过查证属实才能作为定案依据。
• 指认的局限性：指认本身仅是线索，需结合其他证据（如转账记录、通讯记录、现场监控、同案犯供述等）形成完整证据链。若仅有指认而无其他证据支持，可能因证据不足无法定罪。

2. 公安机关的调查流程

• 初步核实：公安机关接到指认后，会先核实指认内容的真实性，例如通过询问指认人、调取相关场所的监控或记录等。
• 深入侦查：若初步核实存在犯罪嫌疑，公安机关会立案侦查，采取技术侦查措施（如监听、跟踪）、搜查、扣押等手段收集证据。
• 证据固定：侦查过程中需严格遵守法定程序，确保证据的合法性。例如，讯问嫌疑人需全程录音录像，搜查需出示搜查证等。

3. 定罪的关键因素

• 证据充分性：根据《刑事诉讼法》第五十五条，定罪需达到“事实清楚，证据确实、充分”的标准。若仅凭指认无法证明老板组织、策划、指挥卖淫活动，可能无法定罪。
• 老板的抗辩权：老板有权对指认提出反驳，例如提供不在场证明、证明自己未参与经营等。若抗辩成立，可能影响定罪。
• 共同犯罪的认定：若老板与卖淫人员存在共同故意（如分工合作、利益分成），可能构成组织卖淫罪的共犯；若仅提供场所或工具，可能构成协助组织卖淫罪。

4. 可能的法律后果

• 老板被查实的情况：若证据充分，老板可能面临《刑法》第三百五十八条规定的组织卖淫罪（五年以上十年以下有期徒刑，情节严重可处十年以上有期徒刑或无期徒刑）或协助组织卖淫罪（五年以下有期徒刑，情节严重可处五年以上十年以下有期徒刑）。
• 老板未被查实的情况：若证据不足，老板可能被释放或不予起诉。指认人若存在诬告陷害行为，可能承担《刑法》第二百四十三条规定的诬告陷害罪责任（三年以下有期徒刑、拘役或管制；造成严重后果的，处三年以上十年以下有期徒刑）。

5. 实务建议

• 对指认人：指认需基于事实，避免虚构或夸大。若指认内容不实，可能面临法律责任。
• 对老板：若被指认，应积极配合调查，同时委托律师提供法律帮助，审查证据合法性，提出无罪或罪轻的辩护意见。
• 对公众：卖淫嫖娼行为违反《治安管理处罚法》，组织卖淫更涉嫌刑事犯罪。应遵守法律法规，避免参与此类活动。

总结：指认老板后，公安机关会依法调查，但能否查实并定罪需结合证据情况。若您或他人涉及此类问题，可直接向我咨询具体法律策略。