结论：公司被查税务时，仅罚款不刑事处罚的情况通常为一般税务违法行为；而涉及严重情节，如逃税数额较大且占应纳税额比例高、暴力抗税等，则可能面临刑事处罚。以下是具体分析：

1. 仅罚款不刑事处罚的情况：

   • 一般税务违法行为：如果公司存在如未按照规定设置账簿、未按照规定保管记账凭证等一般性的税务违法行为，且这些行为并未导致国家税收重大损失，税务机关通常会根据违法情节的轻重，对公司处以罚款，并责令其限期改正，而不会追究刑事责任。
   • 逃税但情节轻微：根据《刑法》第二百零一条的规定，纳税人采取欺骗、隐瞒手段进行虚假纳税申报或者不申报，逃避缴纳税款数额较大并且占应纳税额百分之十以上的，才构成逃税罪。如果公司逃税的数额未达到“数额较大”的标准，或者虽然数额较大但占应纳税额的比例未达到百分之十，那么通常只会受到税务机关的行政处罚，如罚款、加收滞纳金等，而不会面临刑事处罚。不过，如果公司在税务机关依法下达追缴通知后，补缴了应纳税款、缴纳了滞纳金并已受行政处罚的，不予追究刑事责任；但是，五年内因逃避缴纳税款受过刑事处罚或者被税务机关给予二次以上行政处罚的除外。

2. 需要刑事处罚的情况：

   • 逃税数额巨大且占应纳税额比例高：如果公司逃税的数额巨大，并且占应纳税额的比例较高，严重损害了国家税收利益，那么税务机关在依法进行行政处罚的同时，还会将案件移送司法机关，由司法机关依法追究公司及其相关责任人员的刑事责任。
   • 暴力抗税：如果公司在税务检查过程中，采取暴力、威胁方法拒不缴纳税款，或者阻碍税务机关依法执行公务，那么这种行为不仅构成了税务违法行为，还可能触犯《刑法》中的妨害公务罪或抗税罪，相关责任人员将面临刑事处罚。
   • 其他严重税务犯罪行为：除了逃税罪和抗税罪外，如果公司还存在如虚开增值税专用发票、骗取出口退税等其他严重的税务犯罪行为，那么相关责任人员也将面临刑事处罚。

建议：公司在日常经营过程中，应严格遵守国家税收法律法规，建立健全的财务管理制度，确保税务申报的准确性和及时性。如果面临税务检查或处罚，应积极配合税务机关的工作，及时补缴税款和滞纳金，以避免不必要的法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。