针对乡镇违章建筑由谁执法的问题，结论前置如下：
乡（镇）人民政府是主要执法主体：在乡、村庄规划区内，对于未依法取得乡村建设规划许可证或未按许可证规定建设的违章建筑，乡（镇）人民政府有权责令停止建设、限期改正；逾期不改正的，可以拆除违建。
县级以上人民政府城乡规划主管部门也可能参与执法：虽然主要执法权在乡（镇）人民政府，但若违章建筑涉及违反城市、镇规划相关规定，且该区域虽属乡镇但规划上与城市、镇有紧密联系时，县级以上人民政府城乡规划主管部门也有权力和职责进行查处。
其他相关部门在特定情况下可能介入：如违章建筑涉及非法占用土地等问题，自然资源部门将介入处理；若违章建筑建设在河道管理范围内或公路建筑控制区内，水利部门和公路管理机构也可能根据相关法律法规进行执法。
详细分析：
乡（镇）人民政府的执法权：
- 根据《中华人民共和国城乡规划法》第六十五条，在乡、村庄规划区内未依法取得乡村建设规划许可证或者未按照乡村建设规划许可证的规定进行建设的，由乡、镇人民政府责令停止建设、限期改正；逾期不改正的，可以拆除。这一条款明确规定了乡（镇）人民政府在乡镇违章建筑执法中的主体地位。
县级以上人民政府城乡规划主管部门的执法权：
- 虽然主要执法权在乡（镇）人民政府，但城乡规划主管部门在城乡规划的制定、实施和监督方面发挥着重要作用。若乡镇违章建筑涉及违反城市、镇规划相关规定，且该区域在规划上与城市、镇有紧密联系，城乡规划主管部门也有权进行查处，以确保城乡规划的统一性和协调性。
其他相关部门的执法权：
- 自然资源部门：若违章建筑涉及非法占用土地等问题，如未经批准或骗取批准非法占用土地建住宅，自然资源部门将根据《中华人民共和国土地管理法》等相关法律法规进行执法，包括责令退还非法占用的土地、限期拆除在非法土地上新建的房屋等。
- 水利部门和公路管理机构：若违章建筑建设在河道管理范围内或公路建筑控制区内，水利部门和公路管理机构将分别根据《中华人民共和国防洪法》、《中华人民共和国河道管理条例》以及《公路安全保护条例》等相关法律法规进行执法，包括责令限期拆除、强行拆除及费用负担等。
实际操作建议：
- 若发现乡镇存在违章建筑行为，首先应向当地的乡（镇）人民政府举报，因为他们是主要的执法主体。
- 在举报时，应尽可能提供详细的违建信息，如违建地点、规模、建设时间等，以便相关部门及时查处。
- 若违建行为涉及非法占用土地、影响河道行洪安全或公路交通安全等特殊情况，也可以同时向自然资源部门、水利部门或公路管理机构反映情况。
总结与提醒：
乡镇违章建筑的执法是一个涉及多个政府部门的综合性工作。各部门之间需密切协作，依据相关法律法规共同维护乡镇建设的秩序和安全。作为乡镇居民或建设者，应增强法律意识，遵守相关法律法规，避免违规建设行为的发生。若遇到相关法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。