在行政协议中，双方是可以约定违约方缴纳土地复垦费用滞纳金的，这一约定具有法律依据。以下从几个方面进行详细分析：

1. 行政协议的性质与约定自由：

   • 行政协议，作为行政机关与公民、法人或其他组织之间设立、变更、终止行政法律关系的协议，虽然具有行政性，但同时也遵循合同法的原则，即双方当事人在不违反法律强制性规定的前提下，享有约定合同内容的自由。
   • 因此，在行政协议中，双方可以就违约责任进行约定，包括约定违约方缴纳滞纳金等。

2. 土地复垦费用的相关规定：

   • 土地复垦费用是用于对因生产建设活动损毁的土地进行复垦的费用，其缴纳和管理通常受到相关法律法规的规范。
   • 在行政协议中约定土地复垦费用的缴纳，是确保土地得到及时复垦、保护土地资源的重要手段。

3. 滞纳金的法律依据：

   • 滞纳金作为一种违约责任形式，其本质是对违约方因违约行为给守约方造成损失的补偿。
   • 在行政协议中约定滞纳金，并不违反法律法规的强制性规定，只要该约定合理、合法，且不损害国家、社会公共利益或他人合法权益，就是有效的。
   • 具体到土地复垦费用，如果违约方未按时缴纳，守约方有权要求其支付滞纳金，以弥补因违约行为造成的损失。这一约定在《中华人民共和国民法典》等法律法规中可以得到支持，虽然民法典未直接规定土地复垦费用滞纳金，但其中关于违约责任和滞纳金的一般规定（如第五百七十七条关于违约责任的规定，以及合同中关于滞纳金或违约金的常见约定方式）为行政协议中约定滞纳金提供了法律基础。

4. 实践中的注意事项：

   • 在约定滞纳金时，双方应明确滞纳金的计算方式、支付时间等具体条款，以避免产生争议。
   • 滞纳金的约定应合理，不得过高或过低，以免损害一方当事人的合法权益。
   • 如果因滞纳金问题产生争议，双方可以通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式解决。

总结与建议： 在行政协议中约定违约方缴纳土地复垦费用滞纳金是合法的，且有助于确保土地复垦工作的顺利进行。然而，在约定时，双方应充分考虑各种因素，确保约定的合理性和合法性。如果遇到相关法律问题或争议，建议直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。