关于您提出的“假残疾证办理烟草证是否会有案底”的问题，这是一个涉及法律与行政规定的重要咨询，我将结合相关法律法规和实际案例，为您详细解答。

首先，需要明确的是，使用假残疾证办理烟草证是违法行为。这种行为不仅违反了《烟草专卖许可证管理办法》中关于许可证申领的真实性和合法性要求，也侵害了残疾人的合法权益，干扰了正常的行业管理秩序。

从法律后果来看，一旦被发现使用假残疾证办理烟草证，相关许可证将被撤销，并且申请人可能会面临法律责任。具体来说，根据《烟草专卖许可证管理办法》的相关规定，如果申请人以欺骗、贿赂等不正当手段取得烟草专卖许可证，烟草专卖局应当予以撤销并收回许可证。此外，因申请人以欺骗等不正当手段取得的烟草专卖许可证被撤销的，申请人3年内不得再次提出申请。

至于是否会有“案底”，这通常指的是犯罪记录或行政处罚记录。虽然使用假残疾证办理烟草证本身可能不直接构成犯罪（除非涉及伪造国家机关证件等更严重的违法行为），但这一行为一旦被发现，相关行政机关会进行记录，并可能作为后续监管和处罚的依据。更重要的是，这种行为会损害个人的诚信记录，对未来的商业活动或个人信誉产生负面影响。

实际案例也印证了这一点。例如，在浙江省杭州市的某起案例中，方某因不符合烟草制品零售店布局规定而申领烟草专卖零售许可证被驳回。随后，他通过借用残疾人证的方式骗领了许可证。检察机关在发现这一情况后，通过检察建议督促烟草主管部门撤销了涉案许可证，并开展了专项行动清退异常许可证。这一案例表明，使用假残疾证办理烟草证是会被发现的，并且会面临相应的法律后果。

综上所述，使用假残疾证办理烟草证是违法行为，不仅会导致许可证被撤销，还可能面临法律责任和诚信记录的损害。因此，我强烈建议您遵守相关法律法规，通过合法途径申领烟草专卖零售许可证。如果您有关于残疾人就业优惠政策或烟草证申领的具体问题，欢迎随时向我咨询，我将为您提供详细、准确的解答。