核心结论：已过仲裁时效的劳动争议补缴社保申请书，在撰写时仍需清晰陈述事实与请求，但需注意可能面临不被受理或败诉的风险。以下是一份申请书的撰写框架及要点说明，供您参考。
撰写框架与要点：
标题与称谓：
- 标题：明确为“补缴社会保险申请书”。
- 称谓：写明接收申请的单位或部门，如“XX市社会保险经办机构”或“XX公司人力资源部”。
申请人信息：
- 包括姓名、性别、年龄、身份证号码、联系方式等基本信息。
事实与理由：
- 劳动关系确认：简述与用人单位建立劳动关系的时间、岗位、劳动合同签订情况等。
- 社保缴纳情况：说明在劳动关系存续期间，用人单位未依法为您缴纳社会保险的具体情况，包括未缴纳的险种、时间段等。
- 仲裁时效说明：虽然已过仲裁时效，但仍需客观陈述您知晓权益受损的时间、曾尝试的维权途径（如与用人单位协商、向相关部门投诉等）以及未能在时效期内申请仲裁的原因（如因不可抗力、其他正当理由等，需具体说明）。
- 法律依据：引用《中华人民共和国社会保险法》、《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》等相关法律法规，说明用人单位有义务为您缴纳社会保险，以及您申请补缴社保的合法性。
申请事项：
- 明确请求用人单位为您补缴劳动关系存续期间未缴纳的社会保险，包括具体险种、补缴时间段及补缴金额（如能计算得出）。
证据材料：
- 列出随申请书一并提交的证据材料清单，如劳动合同、工资单、工作证、与用人单位协商的记录、向相关部门投诉的回执等，以证明劳动关系及用人单位未缴纳社保的事实。
结尾与签名：
- 表达希望社会保险经办机构或用人单位能够依法处理您的申请，并注明申请日期。
- 申请人签名及按手印。
注意事项：
- 时效问题：虽然您已准备申请书，但需明确知晓，根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。因此，您的申请可能面临不被受理或败诉的风险。
- 协商与投诉：在提交申请书前，建议再次尝试与用人单位协商解决，或向当地社会保险行政部门投诉，看是否能通过行政手段促成补缴。
- 法律途径：若协商与投诉无果，且您仍坚持要求补缴社保，可考虑通过法律诉讼途径解决，但需做好可能因时效问题而败诉的心理准备。
示例段落（事实与理由部分）：
“本人自XXXX年XX月起与XX公司建立劳动关系，担任XX岗位工作，双方签订了书面劳动合同。然而，在劳动关系存续期间，XX公司未依法为本人缴纳社会保险，具体未缴纳的险种为养老保险、医疗保险等，时间段为XXXX年XX月至XXXX年XX月。本人于XXXX年XX月知晓权益受损后，曾多次与XX公司协商补缴事宜，但未果。后因个人原因及对法律程序的不了解，未能在仲裁时效期内申请仲裁。现本人特向贵机构申请，请求依法责令XX公司为本人补缴上述时间段内未缴纳的社会保险。”
希望以上内容能对您有所帮助。如有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。