通过不正当手段获得工程，一般不能拿到合法补偿，甚至可能面临法律责任。以下从不同角度为你详细分析：

法律后果角度

从法律层面来看，通过不正当手段获取工程，比如行贿、串通投标等行为，是违反法律法规的。以串通投标为例，根据《中华人民共和国招标投标法》第五十三条规定，投标人相互串通投标或者与招标人串通投标的，投标人以向招标人或者评标委员会成员行贿的手段谋取中标的，中标无效。这意味着，通过这种不正当方式获得的工程合同自始无效，既然合同无效，那么基于该合同主张补偿也就缺乏合法依据。而且，相关责任主体还可能面临行政处罚，如罚款、没收违法所得等；情节严重的，可能会被追究刑事责任，如构成串通投标罪，根据《中华人民共和国刑法》第二百二十三条规定，可处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。

合同效力角度

合同生效需要满足一定的条件，包括行为人具有相应的民事行为能力、意思表示真实、不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗等。通过不正当手段获得的工程合同，由于违反了法律法规的强制性规定，属于无效合同。无效的合同自始没有法律约束力，也就不能按照合同约定获得相应的补偿。例如，甲乙双方通过贿赂招标方人员的方式获得了某工程项目的承包权，并签订了施工合同。后来该行为被发现，此施工合同就会被认定为无效合同，甲不能依据该合同向招标方要求支付工程款等补偿。

实际处理角度

在实际处理中，即使工程已经进行了一部分，通过不正当手段获得工程的一方也很难获得合法补偿。因为工程的建设是基于非法行为展开的，相关部门会介入调查，纠正违法行为。对于已经完成的工程部分，可能会进行评估，但这种评估也是为了确定如何处理非法所得和恢复合法秩序，而不是为了给予不正当获利方补偿。比如，政府发现某工程是通过不正当手段获得的，会责令停止施工，对已完成的工程进行鉴定，如果工程质量合格，可能会将工程收回，按照合法程序重新招标；对于不正当获利方投入的成本，可能会根据具体情况，在扣除其违法所得和应承担的法律责任后，酌情处理，但绝不是按照正常合同补偿的标准来支付。

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