医院与患者签订协议进行治疗，在合法合规的前提下是可行的。不过，这一行为是否合法，需结合具体情况及协议内容来综合判断。以下从不同角度为你详细分析：
合法情形
协议内容合法合规：
- 医院与患者签订的协议，若内容符合法律法规的规定，不违反公序良俗，且双方意思表示真实，那么该协议是合法有效的。例如，协议中明确约定了治疗方式、费用、风险承担等关键条款，且这些条款均符合医疗行业的规范和标准。
患者充分知情并同意：
- 在签订协议前，医院有义务向患者充分告知治疗的风险、效果、费用等相关信息，确保患者在充分知情的基础上做出自主选择。若患者同意并签署了协议，那么该协议在法律上是被认可的。
协议不违反强制性规定：
- 医疗行为受到严格的法律监管，医院与患者签订的协议不得违反医疗行业的强制性规定。例如，协议中不得包含免除医院法定责任、加重患者责任或排除患者主要权利等无效条款。
非法或存在风险情形
协议内容违法或显失公平：
- 若协议内容违反法律法规的规定，或者存在显失公平的情况（如医院利用优势地位迫使患者接受不合理的条款），那么该协议可能被认定为无效或可撤销。
患者未充分知情或被迫签署：
- 若医院在签订协议前未充分告知患者相关信息，或者患者是在被迫、欺诈等情况下签署的协议，那么该协议在法律上可能不被认可。
协议涉及非法医疗行为：
- 若协议中涉及非法医疗行为（如未经批准的医疗技术、非法行医等），那么该协议不仅无效，还可能涉及刑事责任。
法律建议
审查协议内容：
- 在签署任何医疗协议前，患者应仔细审查协议内容，确保自己充分理解并同意其中的条款。如有疑问，可寻求专业法律人士的帮助。
保留相关证据：
- 在签署协议及接受治疗过程中，患者应保留好相关证据（如协议文本、医疗记录、费用清单等），以便在发生纠纷时维护自己的合法权益。
及时咨询法律人士：
- 若患者对协议内容或治疗过程存在疑虑，应及时咨询法律人士，了解自己的权利和义务，以及可能面临的法律风险。
总结来说，医院与患者签订协议进行治疗本身并不违法，但关键在于协议内容是否合法合规、患者是否充分知情并同意、以及协议是否违反强制性规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。