针对两个不同主体跨省转移固废和倾倒固废的行为，行政处罚的立案方式需根据具体情况进行判断，一般可能分别立案，但在特定情形下也可能一案处理。以下从不同角度进行详细分析：
一、分别立案的情形
行为主体与行为性质独立：
- 若两个不同主体各自独立实施了跨省转移固废和倾倒固废的行为，且这些行为在时间、地点、方式等方面均无明显关联，那么行政机关通常会对每个主体的违法行为分别进行立案调查。
- 例如，主体A将固废从甲省转移至乙省并倾倒，主体B则将固废从丙省转移至丁省并倾倒，且两者之间无任何联系。在此情况下，行政机关会分别对主体A和主体B的违法行为进行立案。
行为后果与责任独立：
- 若每个主体的违法行为均造成了独立的危害后果，且这些后果之间无直接关联，那么行政机关也会分别立案。
- 例如，主体A的倾倒行为导致乙省某地区环境污染，主体B的倾倒行为则导致丁省另一地区环境污染，且两者污染范围、程度等均不同。在此情况下，行政机关会分别对主体A和主体B的违法行为进行立案，并分别追究其法律责任。
二、一案处理的情形
行为存在关联或共同故意：
- 若两个不同主体之间存在共同故意或行为之间存在明显关联，如共同策划、分工合作实施跨省转移固废和倾倒固废的行为，那么行政机关可能会将这些行为视为一案进行立案调查。
- 例如，主体A和主体B共同策划将固废从甲省转移至乙省并倾倒，其中主体A负责运输，主体B负责倾倒。在此情况下，行政机关会将主体A和主体B的违法行为视为一案进行立案，并共同追究其法律责任。
行为后果相互交织或难以区分：
- 若两个不同主体的违法行为造成的后果相互交织或难以区分，如多个主体的倾倒行为导致同一地区环境污染，且无法准确区分各自造成的污染范围、程度等，那么行政机关也可能会将这些行为视为一案进行立案调查。
- 在此情况下，行政机关会综合考虑各主体的行为性质、情节、后果等因素，共同追究其法律责任。但需要注意的是，这种处理方式需要谨慎适用，以确保不损害各主体的合法权益。
三、法律建议
对于行政机关：
- 在处理此类案件时，应仔细审查各主体的行为性质、情节、后果等因素，确保立案方式的合理性和合法性。
- 若存在共同故意或行为关联等情形，应及时将相关行为视为一案进行立案调查，以避免重复处理或遗漏处理。
对于涉案主体：
- 若被行政机关立案调查，应积极配合调查工作，如实陈述事实、提供证据等。
- 若认为行政机关的立案方式不合理或存在错误，可依法提出异议或申请行政复议、提起行政诉讼等。
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