假种子问题确实主要由农业局进行处罚，但具体处罚措施和依据需结合相关法律法规来详细分析。

1. 行政处罚的法律依据与措施：

   • 根据《中华人民共和国种子法》的相关规定，对于生产、销售假种子的行为，县级以上人民政府农业、林业主管部门有权采取一系列行政处罚措施。这些措施包括但不限于责令停止生产经营、没收违法所得和种子、罚款以及吊销种子生产经营许可证等。
   • 具体罚款标准依据货值金额而定，货值金额不足五千元的，处五千元以上五万元以下罚款；货值金额五千元以上不足一万元的，并处一万元以上十万元以下罚款；货值金额一万元以上的，并处货值金额十倍以上二十倍以下罚款。对于情节严重的违法者，还将吊销其种子生产经营许可证。

2. 处罚的时效性：

   • 农业局对销售假种子行为的行政处罚并非无期限的。根据《中华人民共和国行政处罚法》的规定，违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚。但涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，上述期限延长至五年。若违法行为有连续或者继续状态的，从行为终了之日起计算追诉时效。

3. 刑事责任的追究：

   • 如果销售假种子的行为构成犯罪，如生产、销售伪劣种子罪，那么除了行政处罚外，还将依法追究刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，根据犯罪情节的轻重，可能面临拘役、有期徒刑，并处罚金等刑罚。

4. 实际指导意义：

   • 对于从事种子生产和销售的人员来说，必须严格遵守相关法律法规，确保种子的质量和真实性，以避免法律责任。
   • 消费者在购买种子时，应选择正规渠道和有信誉的商家，仔细核对种子标签信息，以降低购买到假种子的风险。
   • 农业农村、林业草原等主管部门应加强监管力度，严厉打击销售假种子的违法行为，保护农业生产者和消费者的合法权益。

举例说明：假设某商家销售了一批假种子给农民，导致农作物大量减产甚至绝收。农民在发现后向农业局投诉，农业局经过调查确认商家存在销售假种子的行为。根据《中华人民共和国种子法》和《中华人民共和国行政处罚法》的相关规定，农业局可以对商家处以罚款、没收违法所得和种子等行政处罚。如果商家的行为构成犯罪，还将依法追究其刑事责任。

总结与建议：假种子问题确实主要由农业局进行处罚，但具体处罚措施和依据需结合相关法律法规来详细分析。如果你或你身边的人遇到了假种子问题，建议及时向农业局投诉并寻求法律帮助。同时，作为消费者，在购买种子时也要提高警惕，选择正规渠道和有信誉的商家进行购买。如果你有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。