结论：签了股份协议但对方拿不出协议，该协议是否有效需分情况讨论，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 协议本身的效力：

   • 有效情形：如果双方确实已经签订了股份协议，且该协议内容不违反法律法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么该协议在双方之间是具有法律效力的。对方拿不出协议，并不影响协议本身的效力。因为协议的效力是基于双方的真实意思表示和合法合规的内容，而不是基于协议是否被物理保存或展示。
   • 无效或可撤销情形：如果协议内容存在违法违规、欺诈、胁迫、显失公平等情形，那么该协议可能是无效或可撤销的。此时，即使对方能拿出协议，该协议也可能因上述原因而被认定为无效或被撤销。

2. 举证责任与证据保存：

   • 举证责任：在法律纠纷中，通常遵循“谁主张，谁举证”的原则。如果一方主张双方签订了股份协议，但对方否认，那么主张签订协议的一方需要承担举证责任，证明协议的存在及其内容。
   • 证据保存：为了证明协议的存在及其内容，最好保留协议的原件或复印件。如果对方拿不出协议，而自己也没有保留相关证据，那么可能会面临举证困难的问题。此时，可以尝试通过其他方式证明协议的存在，如寻找见证人、提供转账记录、聊天记录等辅助证据。

3. 实际履行情况：

   • 实际履行作为证据：如果双方已经按照股份协议的实际内容进行了履行，如一方已经出资、另一方已经分配股权等，那么这些实际履行情况也可以作为证明协议存在的证据。
   • 未履行的影响：如果协议签订后双方并未实际履行，且对方拿不出协议，那么主张签订协议的一方可能会面临更大的举证困难。此时，需要更加谨慎地收集其他证据来证明协议的存在及其内容。

4. 法律建议：

   • 保留证据：无论协议是否被对方拿出，都建议保留好与协议相关的所有证据，包括原件、复印件、电子邮件、短信、聊天记录等。
   • 及时沟通：如果对方拿不出协议，建议及时与对方沟通，了解原因并尝试协商解决方案。如果沟通无果，可以考虑通过法律途径解决纠纷。
   • 寻求法律帮助：如果面临复杂的法律纠纷或举证困难，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。

举例说明：假设甲和乙签订了一份股份协议，约定甲出资100万元获得乙公司10%的股权。协议签订后，甲按照约定出资，但乙却未能按照约定分配股权。此时，如果乙拿不出协议，但甲保留了转账记录和与乙的聊天记录等证据，那么甲仍然可以通过法律途径要求乙履行协议或承担违约责任。

进一步思考：在签订股份协议时，建议双方都保留好协议的原件或复印件，并尽可能通过电子邮件、短信等方式确认协议的内容和签订情况。这样，在面临纠纷时，可以更加容易地证明协议的存在及其内容，从而维护自己的合法权益。如果遇到相关问题，可以直接向我咨询。