若电动摩托车被交警扣押后遭损，您有权要求相关部门承担赔偿责任，具体处理方式如下：

1. 确认扣押程序合法性
   首先需核实交警扣押车辆是否符合法定程序。根据《道路交通安全法》第72条，交警因收集证据需要可扣留事故车辆，但需出具《行政强制措施凭证》并告知扣押理由、期限及救济途径。若扣押程序存在违法（如未出具凭证、超期扣押等），您可主张程序违法，要求撤销扣押并索赔。

2. 固定车辆损坏证据
   立即对车辆损坏情况进行取证，包括：

   • 拍摄车辆被扣押前后的照片/视频，对比损坏部位；
     
   • 记录扣押时间、地点、交接人员信息；
     
   • 委托第三方机构出具车辆损坏鉴定报告（如维修厂评估单）。
     证据需能证明损坏发生在扣押期间，且非您自身原因导致。

3. 向扣押部门提出书面索赔
   根据《国家赔偿法》第4条，行政机关违法行使职权造成财产损害的，受害人有权获得赔偿。您需向扣押车辆的交警部门提交书面索赔申请，附上证据材料，明确赔偿金额（如维修费、折旧费等）及计算依据。部门应在收到申请后2个月内作出赔偿决定。

4. 申请行政复议或提起行政诉讼
   若扣押部门拒绝赔偿或赔偿金额不合理，您可：

   • 行政复议：向其上级公安机关或同级政府申请复议，期限为知道赔偿决定之日起60日内；
     
   • 行政诉讼：直接向法院起诉，期限为知道赔偿决定之日起6个月内。
     诉讼中需重点证明：扣押行为违法、损坏与扣押存在因果关系、赔偿请求合理。

5. 特殊情形处理

   • 若损坏因不可抗力（如自然灾害）导致，扣押部门可能免责，但需其举证；
     
   • 若您存在过错（如未按规定停放车辆导致损坏扩大），可能需承担部分责任。

行动建议：

1. 优先通过协商或索赔程序解决，效率较高；
   
2. 若协商无果，及时启动复议或诉讼，避免超过时效；
   
3. 委托律师协助取证、撰写法律文书，可提高索赔成功率。
   

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