结论：在此情况下，甲方很可能构成违约，但具体是否违约还需根据租赁合同的具体条款以及实际情况来判断。
分析如下：
从租赁合同的角度：
- 租赁合同是双方意思表示一致的协议，其中应明确双方的权利和义务。如果租赁合同中明确规定了房屋的使用目的（如仅供居住，或可注册公司等），并且甲方在出租时未告知房屋已被注册公司，导致乙方无法按照合同约定的目的使用房屋（如无法办理营业执照），那么甲方很可能构成违约。
- 即便合同中没有明确规定房屋的使用目的，但根据一般租赁合同的惯例和目的，出租方应保证房屋能够满足承租方的基本使用需求。如果因为房屋已被注册公司导致乙方无法办理营业执照，这通常会被视为甲方未履行其基本义务，从而构成违约。
从实际影响的角度：
- 乙方租赁房屋的目的可能是为了开展商业活动，而办理营业执照是开展商业活动的必要前提。如果因为房屋已被注册公司导致乙方无法办理营业执照，这将直接影响乙方的商业计划和利益，因此甲方应承担相应的违约责任。
可能的法律后果：
- 如果甲方构成违约，乙方有权要求甲方承担违约责任，包括但不限于赔偿损失、解除合同等。具体责任形式应根据合同约定和实际情况来确定。
- 如果双方无法就违约责任达成一致，乙方可以通过法律途径来维护自己的权益，如向法院提起诉讼或申请仲裁。
建议：
- 查看租赁合同：首先，乙方应仔细查看租赁合同中的相关条款，特别是关于房屋使用目的和甲方义务的条款。
- 与甲方协商：如果合同中有相关条款或甲方确实存在违约行为，乙方可以与甲方进行协商，要求甲方承担相应的违约责任。
- 寻求法律帮助：如果协商无果，乙方可以寻求法律帮助，通过法律途径来维护自己的权益。在此过程中，乙方可以咨询专业律师（如我，李加刚律师，专注于房产纠纷等领域），以获取更具体的法律建议和帮助。
额外提醒：在签订租赁合同时，双方应尽可能明确房屋的使用目的、甲方义务以及违约责任等条款，以避免类似纠纷的发生。如果遇到类似问题，应及时咨询专业律师以维护自己的合法权益。