核心结论：合同未明确约定到期后地上物补偿方式时，补偿标准需结合法律规定、合同履行情况及地方政策综合判断，具体分以下三种情形处理：
1. 优先适用合同约定与法律补充规则
根据《民法典》第510条，若合同未约定补偿方式，双方应先协商补充；协商不成时，需结合以下规则：
- 合同目的与行业惯例：若承包目的是种植经济作物（如果树、药材），通常按地上物实际价值补偿（如评估价或市场价）；若为普通农作物，可能仅补偿剩余种植周期的预期收益。
- 地方政府规范性文件：部分地区出台了《农村土地承包经营权流转管理办法》或补偿标准细则，例如某省规定“果树按树龄折价补偿，建筑物按重置成本折旧补偿”，需查询当地政策。
- 公平原则：若地上物系承包方投入大量资金建设（如温室大棚），法院可能参照《民法典》第6条公平原则，判决发包方给予合理补偿。
2. 区分地上物所有权与补偿对象
- 承包方自建地上物：若地上物（如房屋、灌溉设施）由承包方出资建设且无相反约定，所有权归承包方，合同到期后原则上应由承包方自行处置；但若发包方同意接收，可协商补偿。
- 发包方提供地上物：若地上物系发包方原有设施（如水利管道），承包方仅享有使用权，合同到期后需无偿归还，无需补偿。
- 混合情形：若地上物由双方共同投资建设，需按投资比例分割所有权，再分别处理补偿问题。
3. 特殊情形下的补偿规则
- 合同被提前解除：若因政府征收、规划调整等公共利益需要提前终止合同，地上物补偿通常按《土地管理法》第48条执行，即“按照被征收土地的原用途给予补偿，包括土地补偿费、安置补助费及地上附着物补偿费”。
- 承包方违约导致合同解除：若因承包方拖欠租金、擅自改变土地用途等违约行为被解除合同，发包方可能无需补偿地上物损失，但需以合同明确约定为前提。
- 不可抗力导致合同终止：如因自然灾害等不可抗力导致合同无法继续履行，双方按公平原则分担损失，地上物补偿可能按残值协商处理。
行动建议：
- 收集证据：整理合同文本、地上物建设投入凭证（如发票、施工合同）、地方政府补偿政策文件等材料；
- 协商优先：主动与政府沟通，明确补偿标准及计算方式，争取达成书面补充协议；
- 法律救济：若协商无果，可向农村土地承包仲裁委员会申请仲裁，或直接向法院起诉，主张按实际损失补偿。
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