结论：工作中被打导致耳膜穿孔申请工伤，公司本身不会直接因员工申请工伤而“受影响”，但可能因未履行安全保障义务或存在管理过失而承担法律责任，同时需配合工伤认定流程。以下从法律责任、工伤认定影响、公司管理角度展开分析：
一、公司不会因员工申请工伤本身“受影响”，但可能因未尽义务担责
根据《工伤保险条例》及《民法典》相关规定，员工在工作时间、工作场所内因工作原因受到事故伤害（包括暴力伤害），应认定为工伤。公司作为用人单位，有义务为员工申请工伤认定、配合调查，并承担工伤保险责任（如支付工伤医疗费、停工留薪期工资等）。若公司未依法履行这些义务，可能面临以下后果：
- 行政处罚：若公司未在30日内为员工申请工伤认定，员工自行申请后，社保部门可责令公司改正；逾期不改正的，可能被处以罚款（《工伤保险条例》第62条）。
- 民事赔偿：若公司对暴力伤害存在过错（如未提供安全工作环境、未及时制止冲突等），员工可要求公司承担补充赔偿责任（《民法典》第1198条）。例如，若公司明知员工间存在矛盾却未调解，导致冲突升级，可能被认定未尽安全保障义务。
二、工伤认定对公司的影响主要体现在流程配合与责任承担上
- 流程配合义务：公司需在收到员工工伤申请后，及时向社保部门提交材料（如劳动合同、医疗证明等），并配合调查。若公司拒绝配合，社保部门可直接依据员工提供的证据作出认定（《工伤保险条例》第19条）。
- 工伤保险基金支付范围外的责任：若公司未依法缴纳工伤保险，所有工伤待遇（如一次性伤残补助金、医疗费等）均由公司承担（《工伤保险条例》第62条）。即使缴纳了工伤保险，公司仍需支付停工留薪期工资、护理费等部分费用。
三、从公司管理角度，暴力伤害事件可能暴露管理漏洞
若员工因工作原因被打（如与客户冲突、同事纠纷），公司需反思：
- 安全培训是否到位：是否定期开展职场暴力防范培训？
- 冲突解决机制是否健全：是否有明确的投诉渠道或调解流程？
- 工作环境是否安全：是否存在高风险岗位未配备防护措施？
建议：公司应主动协助员工申请工伤认定，同时排查管理漏洞，避免类似事件再次发生。若员工担心公司报复或拒绝配合，可向当地社保部门或劳动监察大队投诉，或直接通过法律途径维护权益。
补充说明：工伤认定流程（员工需知）
- 申请时限：员工需在事故发生后1年内申请工伤认定（公司未申请的，员工可自行申请）；
- 所需材料：工伤认定申请表、劳动关系证明、医疗诊断证明等；
- 认定结果：社保部门应在60日内作出决定，并书面通知员工和公司。
最后提醒：若您或同事遇到类似情况，建议第一时间报警（保留暴力伤害证据）、就医（保存医疗记录），并及时向公司或社保部门申请工伤认定。如有疑问，可直接向我咨询具体流程或证据收集要点。