您好，关于主管部门开除员工（这里主要指的是公务员，因为对于非公务员员工，开除程序可能因企业性质、劳动合同及内部规章制度而有所不同）需要走的程序，我可以根据《公务员辞退规定》为您详细解答。

首先，需要明确的是，公务员的辞退并非随意进行，而是必须依照法定的情形、权限和程序来办理。根据规定，公务员在以下情形之一时，可能会被辞退：

1. 在年度考核中，连续2年被确定为不称职的；
2. 不胜任现职工作，又不接受其他安排的；
3. 因所在机关调整、撤销、合并或者缩减编制员额需要调整工作，本人拒绝合理安排的；
4. 不履行公务员义务，不遵守法律和公务员纪律，经教育仍无转变，不适合继续在机关工作，又不宜给予开除处分的；
5. 旷工或者因公外出、请假期满无正当理由逾期不归连续超过15个工作日，或者1年内累计超过30个工作日的。

然而，也有一些情形下公务员是不得被辞退的，比如：

1. 因公致残，被确认丧失或者部分丧失工作能力的；
2. 患病或者负伤，在规定的医疗期内的；
3. 女性公务员在孕期、产假、哺乳期内的；
4. 法律、行政法规规定的其他不得辞退的情形。

如果确实需要辞退公务员，那么需要按照以下程序来办理：

1. 所在单位提出建议：所在单位在核准事实的基础上，提出辞退建议，并填写《辞退公务员审批表》报任免机关。

2. 组织人事部门审核：组织人事部门会对辞退建议进行审核，确保符合辞退条件和程序。

3. 任免机关集体讨论并审批：任免机关会集体讨论并审批辞退决定。如果拟辞退的公务员按照规定需要进行经济责任审计的，应当事先对其进行审计。任免机关根据有关规定也可以直接作出辞退决定。对于县级以下机关辞退公务员，还需要由县级公务员主管部门审核并报县级党委审批后作出决定。

4. 送达辞退通知书：作出辞退决定的，应当向被辞退公务员送达《辞退公务员通知书》，告知辞退依据和理由，同时将辞退决定送呈报单位。

5. 办理公务交接手续：被辞退公务员需要办理公务交接手续，确保工作的连续性和稳定性。

6. 存档和备案：将《辞退公务员审批表》和辞退决定等存入本人人事档案，同时将辞退决定送同级公务员主管部门备案。

此外，被辞退公务员对辞退决定不服的，可以按照规定申请复核或者提出申诉。复核、申诉期间不停止辞退决定的执行。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或者需要进一步的解释，请随时告诉我。