结论：在缺少乘客陈述，但其他材料齐全且车主认可的情况下，仍然有可能对其非法营运行为进行处罚，不过具体处罚的成立还需结合其他证据和具体情况综合判断。
分析说明：
非法营运的认定依据：
- 非法营运通常指的是未取得道路运输经营许可，擅自从事道路运输经营活动的行为。其认定主要依据包括：是否存在营运行为、是否取得了相应的营运许可、是否以营利为目的等。
- 在实践中，交通执法部门会综合多种证据来认定非法营运行为，如车辆行驶记录、乘客证言、交易记录、车主的陈述等。
乘客陈述的作用：
- 乘客陈述是证明非法营运行为的重要证据之一，它可以直接证明车主与乘客之间存在营运关系，以及营运的具体情况（如时间、地点、费用等）。
- 然而，乘客陈述并非认定非法营运行为的唯一证据。即使缺少乘客陈述，如果其他证据充分，仍然可以认定非法营运行为。
其他材料齐全且车主认可的情况：
- 如果其他材料（如车辆行驶记录、交易记录、车主的陈述等）齐全，并且车主也认可其从事了非法营运行为，那么这些材料可以构成认定非法营运行为的充分证据。
- 车主的认可尤其重要，因为它表明车主对其行为的性质有清晰的认识，并且愿意承担相应的法律责任。
可能的法律后果：
- 如果被认定非法营运，车主可能会面临罚款、没收违法所得、扣留或吊销驾驶证等行政处罚。
- 在严重的情况下，如果非法营运行为构成了犯罪（如非法经营罪），车主还可能面临刑事处罚。
行动建议：
- 对于执法部门：在缺少乘客陈述的情况下，应尽可能收集其他证据来证明非法营运行为，如通过调取车辆行驶记录、交易记录等，并结合车主的陈述进行综合判断。
- 对于车主：如果确实从事了非法营运行为，应主动配合执法部门的调查，并接受相应的处罚。同时，也可以考虑咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及可能的法律后果。
特殊场景提醒：
- 如果车主对非法营运的认定有异议，或者认为执法部门的处罚不当，可以通过法律途径进行申诉或维权。
- 在处理此类案件时，应确保所有证据的合法性和有效性，避免因证据问题导致处罚不成立或引发其他法律纠纷。
如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。