结论：纪委调查取证要求证人配合跨市区时，证人原则上应当配合，但在特定情况下可以依法提出合理理由并申请调整配合方式或时间。以下从多个角度进行详细分析：

一、证人配合纪委调查取证的法定义务

根据《中华人民共和国监察法》及相关规定，证人作为知晓案件情况的人，有义务配合监察机关的调查取证工作。这包括按照要求提供证言、出示相关证据材料等。当纪委要求证人跨市区配合调查时，证人原则上应当遵守这一法定义务，按时到达指定地点接受调查。

二、证人可以提出合理理由并申请调整配合方式或时间的情形

尽管证人有配合调查的法定义务，但在某些特定情况下，证人可能因客观原因无法按时跨市区配合调查。此时，证人可以依法向纪委提出合理理由，并申请调整配合方式或时间。这些合理理由可能包括：

1. 健康原因：证人因疾病、伤残等健康问题无法长途旅行或长时间接受调查。
2. 工作原因：证人因工作性质特殊（如医生、警察等需要随时待命的工作），无法在规定时间内离开工作岗位。
3. 家庭原因：证人需要照顾年幼的子女、年迈的父母或其他需要照顾的家庭成员，无法离开家庭。
4. 其他合理理由：如证人正在参加重要的考试、会议等，且无法调整时间。

在提出合理理由时，证人应当尽可能提供相关证据材料以支持其申请。例如，提供医院诊断证明、工作单位出具的证明、家庭情况说明等。

三、证人拒绝配合的法律后果

如果证人无正当理由拒绝配合纪委的调查取证工作，可能会面临一定的法律后果。根据《中华人民共和国监察法》及相关规定，证人拒绝配合调查或提供虚假证言的，监察机关可以依法给予警告、罚款等处罚；情节严重的，还可能构成犯罪，依法追究刑事责任。

四、建议与注意事项

1. 及时沟通：如果证人因客观原因无法按时跨市区配合调查，应当及时与纪委沟通，说明情况并提出合理申请。
2. 保留证据：在提出合理理由时，证人应当尽可能保留相关证据材料以支持其申请。
3. 遵守法律：无论何种情况，证人都应当遵守法律法规，不得拒绝配合或提供虚假证言。

总结与进一步思考：证人配合纪委调查取证是法定义务，但在特定情况下可以依法提出合理理由并申请调整配合方式或时间。作为证人，应当了解自己的权利和义务，并在遇到问题时及时寻求法律帮助。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。