在司法实践中，申请撤诉但法院不同意的情况确实存在，这主要基于法律对撤诉条件的严格规定以及法院对案件审理的审慎态度。以下是一些法院不同意撤诉的常见情形：
撤诉可能损害国家利益、社会公共利益或他人合法权益：
- 法院在审理案件时，不仅关注当事人的个人利益，还承担着维护国家利益和社会公共利益的责任。如果撤诉可能导致这些利益受损，法院通常会拒绝撤诉申请。例如，在涉及环境污染、食品安全等公共利益的案件中，即使原告提出撤诉，法院也可能基于公共利益的考虑而不同意。
撤诉违反法律强制性规定或违背公序良俗：
- 法律对某些行为有明确的禁止性规定，如果撤诉行为违反了这些规定，或者违背了社会公认的道德准则（公序良俗），法院将不会允许撤诉。例如，在涉及家庭暴力、虐待等违法行为的案件中，撤诉可能被视为对违法行为的纵容，因此法院可能不同意。
撤诉可能影响案件的公正审理或导致诉讼程序混乱：
- 法院在审理案件时，需要确保诉讼程序的公正性和有序性。如果撤诉可能导致案件审理的混乱或影响其他当事人的合法权益，法院可能会拒绝撤诉。例如，在共同诉讼中，如果部分原告提出撤诉，但撤诉可能影响其他原告的权益或案件的整体审理进度，法院可能不同意。
撤诉申请不符合法定形式或程序要求：
- 法律对撤诉申请的形式和程序有明确规定，如撤诉申请应当书面提出、应当在特定时间内提出等。如果撤诉申请不符合这些法定要求，法院可能会拒绝受理或不同意撤诉。例如，如果原告未在规定时间内提交撤诉申请，或者撤诉申请未以书面形式提出，法院可能不同意撤诉。
法院认为撤诉并非原告真实意思表示：
- 在某些情况下，法院可能怀疑撤诉申请并非原告的真实意愿，而是受到他人胁迫、欺诈或误导等。为了保护原告的合法权益，法院可能会要求原告提供进一步证据证明撤诉是其真实意思表示，或者拒绝撤诉申请。
针对上述情形，如果你作为当事人遇到了法院不同意撤诉的情况，可以采取以下措施：
- 了解具体原因：首先，与法院沟通，了解法院不同意撤诉的具体原因。这有助于你针对性地解决问题或调整策略。
- 提供充分证据：如果法院认为撤诉可能损害他人利益或违反法律规定，你可以尝试提供充分证据证明撤诉不会造成这些后果。例如，提供和解协议、赔偿协议等证据。
- 遵循法定程序：确保你的撤诉申请符合法定形式和程序要求。如果申请存在瑕疵，及时修正并重新提交。
- 考虑其他解决方式：如果撤诉确实不可行，你可以考虑与对方协商调解、继续诉讼或其他解决纠纷的方式。
最后，需要强调的是，撤诉是当事人的一项权利，但这项权利的行使必须受到法律的限制和约束。在申请撤诉时，务必确保你的行为符合法律规定和法院的要求，以避免不必要的法律纠纷和损失。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。