核心结论：农村地基被他人侵占，可通过协商、行政投诉、民事诉讼等途径解决，具体如下：

1. 协商解决
   首先尝试与侵占方友好沟通，明确告知对方其行为已侵犯你的合法权益（如宅基地使用权），要求其停止侵占并恢复原状。协商时注意保留证据（如录音、书面协议），若对方同意退还，可签订书面协议明确归还时间、方式等细节，避免后续纠纷。

2. 行政投诉
   若协商无果，可向当地乡镇政府土地管理部门或农业农村局投诉。根据《土地管理法》第十四条，农村宅基地使用权受法律保护，政府有权对非法侵占行为进行调查并责令退还。投诉时需提供宅基地权属证明（如集体土地使用证、建房审批文件）、侵占现场照片等证据，政府将依法处理并反馈结果。

3. 民事诉讼
   若行政途径未解决问题，可向法院提起返还原物纠纷或排除妨害纠纷诉讼。需准备以下证据：

   • 宅基地权属证明（如土地证、建房许可证）；
     
   • 侵占事实证据（如现场照片、视频、证人证言）；
     
   • 协商记录或行政投诉材料（证明已履行前置程序）。
     法院将根据证据判决侵占方停止侵害、返还土地或赔偿损失。若对方拒不履行判决，可申请强制执行。

4. 特殊情形处理

   • 历史遗留问题：若宅基地权属存在争议（如未确权、继承纠纷），需先通过行政确权或继承诉讼明确权属，再主张权利。
     
   • 长期侵占：若侵占超过20年且未主张权利，可能涉及诉讼时效问题，但若侵占行为持续存在，仍可起诉要求返还。
     
   • 暴力侵占：若对方采取威胁、破坏等手段，可同时报警追究其治安或刑事责任（如故意毁坏财物罪）。

行动建议：

1. 立即收集证据（权属证明、侵占现场材料）；
   
2. 优先通过乡镇政府或农业农村局投诉，效率较高；
   
3. 若情况紧急或复杂，可直接联系我进一步分析证据并制定诉讼策略。