针对您提出的“机动车超员两名儿童怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，需要明确的是，在计算机动车超载比例时，无论成人还是小孩，均按一人计算。因此，如果您的机动车原本核载一定人数，而多载了两名儿童，那么这两名儿童都将被计入超载人数中。

接下来，我们根据超载比例以及相关法律法规来具体分析处罚情况：

一、超载比例计算与处罚标准

1. 超载未达20%：

   • 如果您的机动车（如5座小车）原本核载5人，但实际搭载了7人（包括两名儿童），超载比例为40%，这明显超过了20%的界限，所以不适用此档处罚。但为了全面性，我仍说明此档处罚：对于7座以下载客汽车，载人超过核定人数未达到20%，一般是一次记1分，并处警告或者二十元以上二百元以下罚款。

2. 超载20%以上未达50%：

   • 以5座小车为例，如上述情况，实际搭载7人，超载40%，属于此档。根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》和《中华人民共和国道路交通安全法》，7座以下载客汽车超载20%以上未达50%，一次记3分，并处二十元以上二百元以下罚款。

3. 超载50%以上未达100%：

   • 如果您的机动车超载比例达到或超过50%，但未达到100%，那么将面临更严厉的处罚。7座以下载客汽车一次记6分，7座以上载客汽车一次记9分，并处二百元以上二千元以下罚款。

4. 超载100%以上：

   • 无论车辆类型如何，超载100%以上都将面临最严厉的处罚，即一次记12分，并处二百元以上二千元以下罚款。

二、特殊情况处理

在实际执法中，如果因紧急情况需要超员，或车辆故障导致的临时超员，驾驶员在向交警说明情况并提供相应证据后，可能会得到一定的谅解和处理上的宽松。但请务必注意，这并不意味着可以随意超员，特殊情况下的处理仍需遵循法律程序和执法人员的判断。

三、建议与提醒

1. 严格遵守交通规则：为了您和他人的安全，请务必严格遵守交通规则，不要超员行驶。超员不仅违法，而且极大地增加了交通事故的风险。

2. 选择合适交通工具：如果确实有需要搭载更多人的情况，应该选择更大容量的交通工具或者分批进行搭载。

3. 了解地区差异：具体的处罚标准可能因地区而异，在实际执法过程中，各地会根据当地的实际情况在法律规定的范围内进行合理裁量。因此，在出行前最好了解当地的交通法规和处罚标准。

综上所述，机动车超员两名儿童将面临严厉的处罚，包括罚款和驾驶证记分。为了您和他人的安全，请务必遵守交通规则，不要超员行驶。