在刑事案件中，补充鉴定主要适用于以下情形：
鉴定内容有遗漏：
- 当原鉴定意见未能全面涵盖案件中所有相关的专门性问题时，就需要进行补充鉴定。例如，在伤害案件中，原鉴定可能只考虑了部分损伤对伤残程度的影响，而遗漏了其他损伤。这时，为了确保鉴定结果的全面性和准确性，就需要对遗漏的部分进行补充鉴定。
发现新的相关鉴定材料：
- 在案件侦办过程中，如果新发现了与鉴定事项有关的新证据、新线索或新资料，这些新材料可能对原有的鉴定结论产生影响。例如，在毒品案件中，原本只鉴定了部分毒品的种类和纯度，但后来又发现了其他毒品或相关证据。这时，就需要通过补充鉴定来重新评估所有毒品的种类和纯度，以确保鉴定结果的准确性和完整性。
对原鉴定意见存在疑问：
- 办案机关、当事人或其辩护人、诉讼代理人如果对原鉴定意见中的某些观点、数据或分析过程提出质疑，就需要通过补充鉴定来进一步明确和解释这些问题。例如，在交通事故案件中，原鉴定可能认为事故是由一方当事人的过错导致的，但另一方当事人或其辩护人可能提出异议，认为事故是由多种因素共同作用的结果。这时，就需要通过补充鉴定来重新分析事故原因和责任划分。
关于补充鉴定的程序规定，有以下几点需要注意：
- 提出主体：公安机关在侦查阶段、人民检察院在审查起诉阶段，如果认为有必要进行补充鉴定，可以要求原鉴定机构进行。同时，当事人及其辩护人、诉讼代理人也可以向办案机关提出补充鉴定的申请，由办案机关综合考量后决定是否启动程序。
- 鉴定机构与鉴定人的选择：原则上，补充鉴定应由原鉴定机构和鉴定人进行，以确保鉴定的连贯性和准确性。但在特殊情况下，如原鉴定机构不具备条件或原鉴定人与案件有利害关系，办案机关可以另行委托其他有资质的鉴定机构和鉴定人。
- 补充鉴定意见的处理：补充鉴定完成后，应出具补充鉴定意见，作为对原鉴定意见的补充和完善。办案机关应对补充鉴定意见进行审查判断，结合案件其他证据，决定是否采信。
在实际操作中，还需要注意以下几点：
- 补充鉴定必须严格遵循刑事诉讼法及相关规定，确保程序的合法性和正当性。
- 补充鉴定应由具备相应资质和能力的鉴定机构和鉴定人进行，以确保鉴定结果的准确性和科学性。
- 补充鉴定意见需经过法庭的质证和认证程序，才能作为定案的根据。这有助于保障当事人的合法权益，确保案件的公正审理。
希望以上解答能对你有所帮助。如果你在刑事案件中遇到任何与补充鉴定相关的问题，或者需要进一步的法律咨询和帮助，请随时向我咨询。