核心结论：土地流转后被他人占用，可通过协商、行政投诉、民事诉讼等途径解决，具体如下：

1. 核实流转合同与权属
   首先需确认土地流转合同的有效性（如是否备案、期限是否届满）及自身权属证明（如土地承包经营权证、流转备案证明）。若合同合法有效且未过期，您作为流转方或受让方对土地享有合法使用权，他人占用构成侵权。

2. 协商解决
   若占用方为善意（如误占或信息不对称），可优先通过协商解决。要求对方停止占用、恢复原状并赔偿损失。协商时建议书面记录过程（如签订《解除占用协议》），避免口头承诺无凭证。

3. 行政投诉
   若协商无果，可向当地农业农村局、自然资源局或乡镇政府投诉。根据《农村土地承包法》第六十四条，行政机关有权责令占用方退还土地，并可对违法行为人处以罚款。投诉时需提交流转合同、权属证明及占用证据（如照片、视频）。

4. 民事诉讼
   若占用方拒不配合，可向法院提起民事诉讼，主张：

   • 排除妨害：要求对方停止占用、返还土地；
     
   • 赔偿损失：按实际损失（如流转收益、土地修复费用）主张赔偿；
     
   • 合同解除：若占用导致合同目的无法实现，可要求解除流转合同。
     诉讼时需提供流转合同、权属证明、占用证据及损失计算依据（如评估报告）。

5. 刑事报案（极端情况）
   若占用方通过暴力、威胁等手段强行占用，可能涉嫌《刑法》第二百四十五条“非法侵入住宅罪”或第二百九十条“聚众扰乱社会秩序罪”，可向公安机关报案。

关键提醒：

• 行动前务必固定证据（如土地现状照片、占用方身份信息、沟通记录）；
  
• 若土地流转未备案，可能影响权属认定，需补充证明材料（如村委会证明、证人证言）；
  
• 涉及集体土地流转的，需确认是否经村民会议三分之二以上成员同意，否则合同可能无效。
  

如有具体细节需进一步分析，可直接向我咨询。