结论：两人可以写一份合同来明确相关权益，但合同内容及效力会受到一定限制，且需注意防范风险。以下为详细分析：
合同效力层面
- 从法律原则上讲，双方自愿签订的合同，只要不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，一般是具有法律效力的。所以，两人可以签订一份合同来约定关于这套房子在不能过户且无法添加女方名字情况下的权益分配、使用规则等内容。例如，可以约定在满足过户条件后，男方需及时将女方名字添加到房产证上；或者约定在婚姻关系存续期间，女方对该房屋享有怎样的居住权、收益权等。
- 不过，由于房屋产权的变动涉及到物权法等相关法律规定，合同中关于物权变动的约定可能无法直接产生物权变动的效力。也就是说，即使合同中约定了未来房子归双方共同所有等内容，在没有完成法定过户手续之前，从物权登记的角度来看，房子可能仍然属于男方个人财产。但合同约定可以作为双方内部权益分配的依据，在发生纠纷时，法院会根据合同的具体内容、双方的真实意思表示等因素来综合判断并处理。
合同内容设计层面
- 明确房屋基本信息：合同中应详细写明房屋的地址、面积、购房合同编号、购房时间、购房款支付情况等具体信息，确保对房屋的描述准确无误，避免日后因房屋信息不明确而产生争议。
- 约定双方权益：根据双方的意愿和实际情况，明确女方在房屋中的权益，如居住权、收益权、未来产权归属等。例如，可以约定女方在婚姻关系存续期间有权居住在该房屋内，且男方不得擅自处分该房屋；或者约定在满足一定条件（如结婚满一定年限、生育子女等）后，房屋产权变更为双方共同所有等。
- 设定违约责任：为了确保合同的履行，应在合同中设定明确的违约责任条款。如果一方违反合同约定，应承担相应的违约责任，如支付违约金、赔偿损失等。违约责任的设定应合理、明确，具有可操作性，以便在发生违约情况时能够有效地维护另一方的合法权益。
- 约定争议解决方式：在合同中约定如果发生争议，双方应通过何种方式解决，如协商、调解、仲裁或诉讼等。选择合适的争议解决方式可以提高解决纠纷的效率，降低解决纠纷的成本。
风险防范层面
- 合同形式要求：为了增强合同的证明力，建议采用书面形式签订合同，并由双方签字或盖章确认。如果可能的话，最好对合同进行公证，公证可以增加合同的公信力，在发生纠纷时，公证文书可以作为有力的证据使用。
- 保留相关证据：在签订合同前后，双方应注意保留与房屋购买、合同签订等相关的证据，如购房发票、付款凭证、聊天记录等。这些证据可以在日后发生纠纷时，帮助证明双方的真实意思表示和合同履行情况。
- 关注房屋产权变动情况：由于房屋目前不能过户，双方应密切关注房屋产权的变动情况，及时了解是否满足过户条件。一旦满足过户条件，应及时办理过户手续，将女方的名字添加到房产证上，以切实保障女方的合法权益。
如果你在签订合同过程中遇到任何问题，或者需要进一步了解相关法律规定，都可以直接向我咨询。